More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0655 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  70.38 
 
 
449 aa  638    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  73.87 
 
 
445 aa  653    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  100 
 
 
452 aa  910    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  70 
 
 
446 aa  627  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  67.94 
 
 
447 aa  600  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  67.21 
 
 
448 aa  600  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  67.6 
 
 
453 aa  596  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  64.06 
 
 
446 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  64.51 
 
 
444 aa  570  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  63.19 
 
 
469 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  62.97 
 
 
446 aa  559  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  63.05 
 
 
449 aa  555  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  63.05 
 
 
449 aa  555  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  63.05 
 
 
449 aa  555  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  63.05 
 
 
449 aa  555  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  63.05 
 
 
449 aa  555  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  62.82 
 
 
449 aa  554  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  62.82 
 
 
449 aa  554  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  62.82 
 
 
449 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  62.39 
 
 
449 aa  553  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  64.59 
 
 
446 aa  551  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  62.16 
 
 
449 aa  552  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  62.82 
 
 
449 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  62.67 
 
 
479 aa  551  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  64.11 
 
 
447 aa  537  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  59.82 
 
 
443 aa  536  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  61.61 
 
 
455 aa  529  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  61.15 
 
 
455 aa  527  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  61.15 
 
 
455 aa  527  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60.84 
 
 
452 aa  521  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  60.81 
 
 
448 aa  523  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  61.48 
 
 
463 aa  513  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  60.13 
 
 
449 aa  512  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  60.19 
 
 
512 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  62 
 
 
454 aa  507  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  62 
 
 
454 aa  507  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  59.69 
 
 
452 aa  504  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  57.91 
 
 
441 aa  502  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  58.43 
 
 
518 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  59.3 
 
 
451 aa  499  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  55.99 
 
 
450 aa  501  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  57.62 
 
 
452 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  57.62 
 
 
452 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  59.4 
 
 
450 aa  494  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  59.3 
 
 
453 aa  492  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  56.36 
 
 
454 aa  488  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  61.02 
 
 
453 aa  490  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  57.62 
 
 
445 aa  486  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  59.16 
 
 
444 aa  486  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  60.79 
 
 
453 aa  488  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  57.21 
 
 
492 aa  484  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  57.44 
 
 
443 aa  482  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  57.24 
 
 
493 aa  479  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.41 
 
 
481 aa  478  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  58.7 
 
 
444 aa  479  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  54.98 
 
 
508 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  55.07 
 
 
449 aa  476  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  56.28 
 
 
444 aa  475  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.31 
 
 
512 aa  471  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  54.69 
 
 
476 aa  474  1e-132  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  56.44 
 
 
447 aa  474  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  54.83 
 
 
433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.48 
 
 
454 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  53.85 
 
 
445 aa  466  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  51.64 
 
 
521 aa  464  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  54.16 
 
 
433 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  54.38 
 
 
436 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.79 
 
 
491 aa  465  9.999999999999999e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  51.6 
 
 
449 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.37 
 
 
449 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  55.48 
 
 
458 aa  458  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  55.48 
 
 
458 aa  458  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  53.36 
 
 
463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  51.14 
 
 
449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  50.11 
 
 
446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1468  signal recognition particle protein  53.39 
 
 
536 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396358 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  52.86 
 
 
435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  51.63 
 
 
520 aa  451  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.63 
 
 
462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  54.69 
 
 
453 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.19 
 
 
470 aa  450  1e-125  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  50.68 
 
 
451 aa  450  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  54.69 
 
 
453 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  52.78 
 
 
443 aa  451  1e-125  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  51.01 
 
 
449 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  54.69 
 
 
453 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  51.6 
 
 
441 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  53.06 
 
 
459 aa  448  1e-125  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2535  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.29 
 
 
483 aa  451  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00293209  normal  0.012093 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  54.69 
 
 
453 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1725  signal recognition particle protein  53.53 
 
 
518 aa  451  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.862121  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.62 
 
 
507 aa  449  1e-125  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.58 
 
 
551 aa  448  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  53.71 
 
 
457 aa  451  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  54.69 
 
 
453 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  54.87 
 
 
453 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  54.69 
 
 
453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.42 
 
 
447 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.36 
 
 
490 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  55.24 
 
 
467 aa  447  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>