More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1725 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  66.86 
 
 		 521 aa  687    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1725  signal recognition particle protein  100 
 
 		 518 aa  1037    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.862121  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  68.68 
 
 		 520 aa  672    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60.66 
 
 		 481 aa  562  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  58.51 
 
 		 507 aa  551  1e-156  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  61.38 
 
 		 476 aa  541  9.999999999999999e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  57.25 
 
 		 491 aa  533  1e-150  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  55.43 
 
 		 455 aa  516  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  55.43 
 
 		 455 aa  514  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  55.43 
 
 		 455 aa  514  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  57.58 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  57.35 
 
 		 446 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  54.44 
 
 		 449 aa  478  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  54.21 
 
 		 449 aa  475  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  54.44 
 
 		 449 aa  478  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  54.44 
 
 		 449 aa  478  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  54.42 
 
 		 449 aa  477  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  54.21 
 
 		 449 aa  476  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  54.21 
 
 		 449 aa  475  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.4 
 
 		 447 aa  477  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  54.67 
 
 		 449 aa  478  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  54.21 
 
 		 449 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  54.44 
 
 		 449 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  54.44 
 
 		 449 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  55.68 
 
 		 446 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  54.15 
 
 		 446 aa  462  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  51.32 
 
 		 449 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  50.75 
 
 		 479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  53.72 
 
 		 445 aa  449  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  52.45 
 
 		 448 aa  449  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.76 
 
 		 452 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  54.52 
 
 		 444 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  52.53 
 
 		 443 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  52.35 
 
 		 453 aa  442  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  51.44 
 
 		 452 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  52.73 
 
 		 448 aa  438  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50 
 
 		 512 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.43 
 
 		 447 aa  438  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  51.87 
 
 		 463 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  54.42 
 
 		 452 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.96 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  51.4 
 
 		 450 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  50.55 
 
 		 492 aa  433  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  49.02 
 
 		 445 aa  435  1e-120  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  50.22 
 
 		 441 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  51.17 
 
 		 443 aa  429  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  52.1 
 
 		 449 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  51.4 
 
 		 453 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  51.04 
 
 		 441 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  49.34 
 
 		 444 aa  428  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  51.65 
 
 		 452 aa  428  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  51.65 
 
 		 452 aa  428  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  48.8 
 
 		 518 aa  425  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  52.26 
 
 		 454 aa  428  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  52.26 
 
 		 454 aa  428  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  50.32 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3143  signal recognition particle protein  51.05 
 
 		 515 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00382292  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  49.12 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  48.89 
 
 		 457 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.59 
 
 		 462 aa  420  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  48.35 
 
 		 446 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  48.67 
 
 		 508 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  51.05 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 493 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  49.78 
 
 		 459 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  49.53 
 
 		 512 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10980  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.64 
 
 		 604 aa  418  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.160469  normal  0.0249025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2535  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.57 
 
 		 483 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00293209  normal  0.012093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1825  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (SRP54)  50 
 
 		 516 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  46.7 
 
 		 456 aa  418  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1147  signal recognition particle protein  48 
 
 		 521 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  46.98 
 
 		 458 aa  413  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  52.26 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  48.98 
 
 		 453 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1048  signal recognition particle protein  49.34 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000196553  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  48.08 
 
 		 478 aa  413  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  48.6 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3204  signal recognition particle protein  50 
 
 		 453 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0069181  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.15 
 
 		 443 aa  415  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  47.85 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  49.21 
 
 		 449 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  52.21 
 
 		 453 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1123  signal recognition particle protein  50 
 
 		 453 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  49.17 
 
 		 442 aa  415  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  47.1 
 
 		 525 aa  409  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  46.53 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1050  signal recognition particle GTPase  49.1 
 
 		 544 aa  411  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4011  signal recognition particle protein  50 
 
 		 528 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.923064  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.43 
 
 		 490 aa  411  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 488 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0328  signal recognition particle protein  48.98 
 
 		 556 aa  410  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.59605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.23 
 
 		 443 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.32 
 
 		 527 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645209  normal  0.354043 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  49.52 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  45.63 
 
 		 522 aa  409  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  49.52 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  49.52 
 
 		 453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  49.52 
 
 		 453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  49.52 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>