More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0915 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  85.02 
 
 		 521 aa  881    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1725  signal recognition particle protein  68.68 
 
 		 518 aa  689    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.862121  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  100 
 
 		 520 aa  1047    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  63.37 
 
 		 476 aa  584  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  62.08 
 
 		 481 aa  576  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  64.14 
 
 		 491 aa  568  1e-161  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  58.03 
 
 		 507 aa  553  1e-156  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  58.29 
 
 		 446 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  58.53 
 
 		 469 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  57.27 
 
 		 449 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  57.27 
 
 		 449 aa  503  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  57.27 
 
 		 449 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  57.27 
 
 		 449 aa  503  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  56.31 
 
 		 455 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  57.97 
 
 		 449 aa  504  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  56.31 
 
 		 455 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  57.51 
 
 		 449 aa  504  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  57.51 
 
 		 449 aa  504  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  57.27 
 
 		 449 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  57.04 
 
 		 449 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  57.48 
 
 		 449 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  57.04 
 
 		 449 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  54.67 
 
 		 455 aa  497  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  57.24 
 
 		 444 aa  488  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  55.37 
 
 		 446 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.88 
 
 		 446 aa  476  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  55.58 
 
 		 448 aa  478  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  51.53 
 
 		 449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.29 
 
 		 447 aa  467  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  53.67 
 
 		 443 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  53.52 
 
 		 453 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  50.44 
 
 		 479 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.9 
 
 		 447 aa  463  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  52.91 
 
 		 446 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  54.76 
 
 		 445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  53.77 
 
 		 452 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  53.77 
 
 		 452 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  51.17 
 
 		 448 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 441 aa  449  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  52 
 
 		 454 aa  449  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.44 
 
 		 512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  51.4 
 
 		 445 aa  443  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  51.71 
 
 		 522 aa  444  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  49.21 
 
 		 444 aa  440  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 450 aa  441  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  49.46 
 
 		 443 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 518 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  50.33 
 
 		 452 aa  435  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  49.53 
 
 		 512 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  49.67 
 
 		 449 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.8 
 
 		 490 aa  435  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  50.35 
 
 		 444 aa  436  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  49.66 
 
 		 492 aa  436  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  51.63 
 
 		 452 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  45.56 
 
 		 517 aa  433  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1825  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (SRP54)  50.81 
 
 		 516 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.45 
 
 		 452 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  51.07 
 
 		 493 aa  433  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 443 aa  434  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  50.59 
 
 		 454 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  50.59 
 
 		 454 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  49.55 
 
 		 444 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  49.78 
 
 		 444 aa  429  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2229  signal recognition particle protein  51.03 
 
 		 527 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  47.48 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1050  signal recognition particle GTPase  50 
 
 		 544 aa  426  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0882  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.31 
 
 		 492 aa  427  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  47.48 
 
 		 446 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  51.42 
 
 		 492 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2535  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.43 
 
 		 483 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00293209  normal  0.012093 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2489  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.57 
 
 		 529 aa  427  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.277512  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  48.9 
 
 		 461 aa  427  1e-118  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3143  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 515 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00382292  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  51.42 
 
 		 492 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10980  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.54 
 
 		 604 aa  423  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.160469  normal  0.0249025 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4020  signal recognition particle protein  51.17 
 
 		 489 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000574509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1771  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.34 
 
 		 496 aa  423  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  48.31 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.88 
 
 		 515 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.08 
 
 		 527 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645209  normal  0.354043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  49.53 
 
 		 441 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  48.68 
 
 		 467 aa  424  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.65 
 
 		 470 aa  422  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  50 
 
 		 453 aa  423  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  47.69 
 
 		 450 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  48.49 
 
 		 508 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17061  signal recognition particle protein (SRP54)  50.12 
 
 		 487 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2543  signal recognition particle protein  49.54 
 
 		 528 aa  420  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.864266  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0328  signal recognition particle protein  48.99 
 
 		 556 aa  421  1e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.59605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4011  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 528 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.923064  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0853  signal recognition particle protein  50.35 
 
 		 487 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1150  signal recognition particle protein  50.59 
 
 		 458 aa  421  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  46.98 
 
 		 451 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  50 
 
 		 488 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3424  signal recognition particle protein  49.54 
 
 		 524 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  48.59 
 
 		 440 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.61 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  47.85 
 
 		 458 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2181  signal recognition particle protein  44.27 
 
 		 522 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.374649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4182  signal recognition particle protein  44.44 
 
 		 535 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>