More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4358 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  75.85 
 
 		 488 aa  699    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  79.01 
 
 		 492 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  100 
 
 		 490 aa  989    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1771  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  78.88 
 
 		 496 aa  670    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  79.01 
 
 		 492 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2535  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  76.94 
 
 		 483 aa  733    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00293209  normal  0.012093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4020  signal recognition particle protein  77.73 
 
 		 489 aa  714    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000574509 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  88.37 
 
 		 485 aa  816    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0882  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  68.59 
 
 		 492 aa  608  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17061  signal recognition particle protein (SRP54)  63.27 
 
 		 487 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0853  signal recognition particle protein  62.86 
 
 		 487 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1517  Signal recognition particle protein  69.05 
 
 		 492 aa  597  1e-169  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13331  signal recognition particle protein (SRP54)  65.97 
 
 		 485 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.367944  normal  0.587075 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19561  signal recognition particle protein (SRP54)  65.66 
 
 		 494 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.20972 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14851  signal recognition particle protein (SRP54)  62.73 
 
 		 498 aa  565  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1382  signal recognition particle protein  62.27 
 
 		 489 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14711  signal recognition particle protein (SRP54)  62.5 
 
 		 492 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.657856  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14471  signal recognition particle protein (SRP54)  62.56 
 
 		 492 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  52.86 
 
 		 443 aa  473  1e-132  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39979  IISP family transporter: signal recognition particle protein (SRP54)  53.96 
 
 		 498 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.2 
 
 		 481 aa  470  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  51.81 
 
 		 492 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  51.88 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  47.66 
 
 		 479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  53.66 
 
 		 469 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  51.04 
 
 		 450 aa  449  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  52.22 
 
 		 444 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  52.08 
 
 		 444 aa  445  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  51.85 
 
 		 444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  51.9 
 
 		 446 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  51.97 
 
 		 445 aa  442  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.09 
 
 		 512 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  51.16 
 
 		 453 aa  443  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  49.45 
 
 		 458 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  49.45 
 
 		 458 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  49.21 
 
 		 441 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  50.69 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.14 
 
 		 491 aa  440  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  48.85 
 
 		 520 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  51.39 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  52.56 
 
 		 444 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 449 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 449 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 518 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 449 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  51.05 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  50.33 
 
 		 451 aa  438  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  51.52 
 
 		 512 aa  435  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 449 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35185  predicted protein  54.37 
 
 		 448 aa  435  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  49.54 
 
 		 508 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  50.7 
 
 		 449 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 449 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  50.9 
 
 		 476 aa  437  1e-121  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 449 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  48.31 
 
 		 521 aa  434  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 449 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  53.36 
 
 		 452 aa  432  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 449 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 443 aa  434  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 449 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 449 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.34 
 
 		 507 aa  432  1e-120  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  52.08 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  50.12 
 
 		 448 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  49.78 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.11 
 
 		 452 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.2 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  52.26 
 
 		 452 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  52.26 
 
 		 452 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  50.92 
 
 		 448 aa  432  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  50.44 
 
 		 449 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  49.42 
 
 		 455 aa  427  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  51.72 
 
 		 458 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  50.69 
 
 		 443 aa  427  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  50.35 
 
 		 493 aa  428  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  51.16 
 
 		 449 aa  425  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  49.65 
 
 		 455 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  49.65 
 
 		 455 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  49 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.77 
 
 		 443 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  51.72 
 
 		 458 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  51.39 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  48.99 
 
 		 449 aa  425  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  51.29 
 
 		 449 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  50.24 
 
 		 435 aa  425  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1725  signal recognition particle protein  49.34 
 
 		 518 aa  423  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.862121  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50 
 
 		 462 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  49.57 
 
 		 485 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  51.34 
 
 		 452 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.53 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.82 
 
 		 447 aa  418  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  51.16 
 
 		 451 aa  421  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.63 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1938  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.38 
 
 		 456 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  50.95 
 
 		 454 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  50.95 
 
 		 454 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>