More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1382 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0853  signal recognition particle protein  70.4 
 
 		 487 aa  680    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1517  Signal recognition particle protein  71.13 
 
 		 492 aa  639    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0882  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  72.75 
 
 		 492 aa  660    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1382  signal recognition particle protein  100 
 
 		 489 aa  974    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14471  signal recognition particle protein (SRP54)  93.06 
 
 		 492 aa  807    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19561  signal recognition particle protein (SRP54)  70.6 
 
 		 494 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.20972 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14711  signal recognition particle protein (SRP54)  97.22 
 
 		 492 aa  837    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.657856  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13331  signal recognition particle protein (SRP54)  70.55 
 
 		 485 aa  658    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.367944  normal  0.587075 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14851  signal recognition particle protein (SRP54)  97.22 
 
 		 498 aa  837    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17061  signal recognition particle protein (SRP54)  70.4 
 
 		 487 aa  680    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  62.36 
 
 		 490 aa  565  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  62.12 
 
 		 485 aa  561  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  61.32 
 
 		 492 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  61.32 
 
 		 492 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  60.7 
 
 		 488 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2535  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60.46 
 
 		 483 aa  537  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00293209  normal  0.012093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4020  signal recognition particle protein  60.56 
 
 		 489 aa  531  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000574509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1771  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  61.76 
 
 		 496 aa  524  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  48.52 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  50.83 
 
 		 469 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  48.41 
 
 		 492 aa  435  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  42.8 
 
 		 479 aa  430  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.37 
 
 		 512 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  49.41 
 
 		 446 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.38 
 
 		 481 aa  426  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  48.04 
 
 		 449 aa  425  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  46.47 
 
 		 521 aa  423  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  49.04 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  47.32 
 
 		 449 aa  423  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  47.92 
 
 		 476 aa  424  1e-117  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  47.34 
 
 		 455 aa  421  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  47.47 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  47.47 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  47.47 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  47.47 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  47.47 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  47.24 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0522  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.24 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  47.48 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  48.48 
 
 		 453 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  48.48 
 
 		 453 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  47.24 
 
 		 449 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  46.88 
 
 		 455 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  48.48 
 
 		 453 aa  415  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0661  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.59 
 
 		 535 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  48.48 
 
 		 453 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  48.48 
 
 		 453 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  46.06 
 
 		 450 aa  416  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.55 
 
 		 452 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  47.24 
 
 		 449 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  48.28 
 
 		 450 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  48.48 
 
 		 453 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  48.48 
 
 		 453 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  47.24 
 
 		 449 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  48.48 
 
 		 453 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  48.48 
 
 		 453 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  48.69 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  50 
 
 		 452 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  50 
 
 		 452 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  46.88 
 
 		 455 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  45.37 
 
 		 449 aa  417  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.69 
 
 		 507 aa  416  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  45.34 
 
 		 520 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  47.24 
 
 		 449 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  44.62 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  46.79 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  46.39 
 
 		 458 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  46.39 
 
 		 458 aa  413  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  48.39 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  48.85 
 
 		 444 aa  415  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  47.48 
 
 		 444 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  48.24 
 
 		 453 aa  414  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  44.37 
 
 		 508 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  46.99 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  48.01 
 
 		 453 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  48.5 
 
 		 443 aa  411  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  45.9 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  47.22 
 
 		 453 aa  411  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  45.75 
 
 		 446 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  48.01 
 
 		 453 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  48.01 
 
 		 453 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.44 
 
 		 446 aa  411  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.32 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  46.35 
 
 		 456 aa  411  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1938  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.1 
 
 		 456 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  48.01 
 
 		 453 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  47.27 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  47.27 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  48.01 
 
 		 453 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  46.46 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  45.77 
 
 		 463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2134  signal recognition particle protein  48.58 
 
 		 449 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.62 
 
 		 447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1123  signal recognition particle protein  47.03 
 
 		 453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  46 
 
 		 457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  48.07 
 
 		 449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35185  predicted protein  50.24 
 
 		 448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  47.4 
 
 		 449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  45.03 
 
 		 445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  47.23 
 
 		 478 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>