More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1286 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  95.27 
 
 
444 aa  849    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  100 
 
 
444 aa  880    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  77.78 
 
 
450 aa  687    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  67.71 
 
 
449 aa  597  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  59.07 
 
 
441 aa  508  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  59.91 
 
 
453 aa  499  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  57.34 
 
 
446 aa  496  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  57.64 
 
 
449 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  57.64 
 
 
449 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  57.64 
 
 
449 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  59.24 
 
 
446 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  57.87 
 
 
449 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  57.64 
 
 
449 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  57.64 
 
 
449 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  57.87 
 
 
449 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  57.87 
 
 
449 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  57.87 
 
 
449 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  57.41 
 
 
449 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  58.47 
 
 
446 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  57.41 
 
 
449 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  58.74 
 
 
448 aa  491  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  57.93 
 
 
445 aa  487  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  59.95 
 
 
447 aa  488  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  57.98 
 
 
469 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  58.17 
 
 
446 aa  486  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  57.3 
 
 
449 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  55.24 
 
 
455 aa  474  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  55.01 
 
 
455 aa  472  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  55.01 
 
 
455 aa  472  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  57.01 
 
 
512 aa  474  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  54.81 
 
 
463 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  57.44 
 
 
444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  54.32 
 
 
508 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  58.7 
 
 
452 aa  465  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  55.35 
 
 
443 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  56.78 
 
 
479 aa  468  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  54.02 
 
 
449 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  54.13 
 
 
518 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.16 
 
 
447 aa  459  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  55.01 
 
 
433 aa  456  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  53.92 
 
 
492 aa  457  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  55.24 
 
 
433 aa  457  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.74 
 
 
512 aa  455  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  53.02 
 
 
476 aa  456  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  53.46 
 
 
453 aa  455  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  52.46 
 
 
444 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.9 
 
 
452 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  54.63 
 
 
448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.91 
 
 
481 aa  451  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  51.61 
 
 
443 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  53.23 
 
 
452 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4020  signal recognition particle protein  52.08 
 
 
489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000574509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.08 
 
 
490 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  52.09 
 
 
443 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  51.12 
 
 
450 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  55.45 
 
 
452 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  55.45 
 
 
452 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  53.29 
 
 
493 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2535  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.85 
 
 
483 aa  445  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00293209  normal  0.012093 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  54.02 
 
 
457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  52.81 
 
 
445 aa  444  1e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  52.19 
 
 
488 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  52.9 
 
 
451 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  53.55 
 
 
454 aa  441  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  53.55 
 
 
454 aa  441  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  52.85 
 
 
457 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  49.67 
 
 
521 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  52.47 
 
 
492 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  54.84 
 
 
453 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  52.23 
 
 
457 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  52.47 
 
 
492 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  50.93 
 
 
485 aa  441  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.99 
 
 
443 aa  439  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  52.55 
 
 
447 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  52.68 
 
 
457 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  52.47 
 
 
444 aa  439  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1158  signal recognition particle protein  52.46 
 
 
457 aa  435  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000642448  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39570  signal recognition particle protein  52.22 
 
 
458 aa  435  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.28 
 
 
443 aa  437  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  54.61 
 
 
453 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.16 
 
 
462 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  53.29 
 
 
454 aa  438  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2839  signal recognition particle protein  53.53 
 
 
457 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000124707  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2921  signal recognition particle protein  53.53 
 
 
457 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000450795  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.03 
 
 
507 aa  434  1e-120  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3018  signal recognition particle protein  53.53 
 
 
457 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000039159  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1253  signal recognition particle protein  53.45 
 
 
457 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000179157  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  49.55 
 
 
463 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1356  signal recognition particle protein  53.08 
 
 
457 aa  431  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  51.1 
 
 
458 aa  428  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3402  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.28 
 
 
458 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.625555 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  51.1 
 
 
458 aa  428  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.8 
 
 
491 aa  431  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  48.79 
 
 
520 aa  429  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1167  signal recognition particle protein  53.99 
 
 
457 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000256544  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2261  Signal recognition particle protein  51.79 
 
 
452 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161738  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1209  signal recognition particle protein  53.76 
 
 
457 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000238593  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  51.52 
 
 
453 aa  425  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3230  signal recognition particle protein  53.09 
 
 
453 aa  428  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0218227  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  51.52 
 
 
453 aa  425  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>