More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10100 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  74.88 
 
 		 470 aa  665    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1376  signal recognition particle protein  79.19 
 
 		 472 aa  661    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010418  normal  0.848046 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  100 
 
 		 478 aa  963    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000697976 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  63.46 
 
 		 459 aa  587  1e-166  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  56.48 
 
 		 446 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  55.97 
 
 		 446 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  55.81 
 
 		 445 aa  462  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  54.19 
 
 		 443 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  55.97 
 
 		 444 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.59 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  51.05 
 
 		 479 aa  448  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  53.88 
 
 		 453 aa  449  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.35 
 
 		 446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  52.35 
 
 		 448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  52.96 
 
 		 469 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.89 
 
 		 481 aa  443  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  51.61 
 
 		 450 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  51.4 
 
 		 449 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  51.4 
 
 		 449 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  51.17 
 
 		 449 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  51.4 
 
 		 449 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  51.4 
 
 		 449 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  51.17 
 
 		 449 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  53.22 
 
 		 448 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  52.62 
 
 		 446 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  51.4 
 
 		 449 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  52.91 
 
 		 449 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 455 aa  435  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  51.17 
 
 		 449 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  54.4 
 
 		 452 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  54.31 
 
 		 444 aa  438  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  51.17 
 
 		 449 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  51.4 
 
 		 443 aa  436  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  51.17 
 
 		 449 aa  436  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4182  signal recognition particle protein  48.72 
 
 		 535 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  50.7 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.62 
 
 		 447 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 451 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.03 
 
 		 452 aa  430  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 455 aa  428  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3424  signal recognition particle protein  53.47 
 
 		 524 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 455 aa  428  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3143  signal recognition particle protein  51.52 
 
 		 515 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00382292  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2181  signal recognition particle protein  51.59 
 
 		 522 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.374649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  51.36 
 
 		 522 aa  428  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  51.92 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  51.28 
 
 		 450 aa  425  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50 
 
 		 454 aa  427  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  51.29 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  52.67 
 
 		 518 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  50.82 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  52.01 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  51.54 
 
 		 493 aa  423  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2543  signal recognition particle protein  51.5 
 
 		 528 aa  425  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.864266  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  48.28 
 
 		 452 aa  422  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5930  signal recognition particle protein  51.86 
 
 		 518 aa  418  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.411186  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0978  signal recognition particle protein  49.46 
 
 		 508 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.304091  normal  0.442389 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 441 aa  422  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  52.5 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  51.63 
 
 		 492 aa  421  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.53 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  50.94 
 
 		 449 aa  420  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.09 
 
 		 515 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.63 
 
 		 551 aa  419  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.23 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1147  signal recognition particle protein  51.63 
 
 		 521 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  50 
 
 		 449 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.75 
 
 		 527 aa  418  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645209  normal  0.354043 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  51.2 
 
 		 435 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  48.62 
 
 		 439 aa  417  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1468  signal recognition particle protein  47.2 
 
 		 536 aa  415  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396358 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4011  signal recognition particle protein  50.58 
 
 		 528 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.923064  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  48.25 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.01 
 
 		 491 aa  417  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  50.7 
 
 		 449 aa  418  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  48.54 
 
 		 525 aa  412  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0661  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.89 
 
 		 535 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12930  signal recognition particle protein ffh  52.97 
 
 		 525 aa  412  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.569051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1825  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (SRP54)  48.58 
 
 		 516 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1190  signal recognition particle protein  49.79 
 
 		 514 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260849  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  51.52 
 
 		 512 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  51.07 
 
 		 442 aa  414  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  50.68 
 
 		 517 aa  413  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1301  signal recognition particle protein  52.01 
 
 		 514 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556432  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09140  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.13 
 
 		 528 aa  412  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  50.92 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 444 aa  409  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  50 
 
 		 444 aa  412  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1165  signal recognition particle protein  50.79 
 
 		 532 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196377  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0645  signal recognition particle protein  49.88 
 
 		 434 aa  408  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.196271  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0328  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 556 aa  411  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.59605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1510  signal recognition particle protein  50 
 
 		 515 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  49.53 
 
 		 449 aa  409  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  50.92 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.47 
 
 		 507 aa  409  1e-113  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  48.83 
 
 		 446 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  48.04 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  47.87 
 
 		 440 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>