More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0223 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5930  signal recognition particle protein  73.13 
 
 
518 aa  664    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.411186  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0978  signal recognition particle protein  69.17 
 
 
508 aa  705    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.304091  normal  0.442389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3143  signal recognition particle protein  63.96 
 
 
515 aa  657    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00382292  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1468  signal recognition particle protein  67.21 
 
 
536 aa  640    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0661  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  81.9 
 
 
535 aa  856    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1825  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (SRP54)  70.41 
 
 
516 aa  734    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0223  signal recognition particle protein  100 
 
 
531 aa  1061    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1510  signal recognition particle protein  72.44 
 
 
515 aa  657    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4011  signal recognition particle protein  71.21 
 
 
528 aa  656    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.923064  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3424  signal recognition particle protein  82.83 
 
 
524 aa  728    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1190  signal recognition particle protein  64.63 
 
 
514 aa  635    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260849  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  74.01 
 
 
515 aa  654    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  70.62 
 
 
551 aa  635    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3266  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  74.63 
 
 
523 aa  669    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0903561  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2243  signal recognition particle protein  72.64 
 
 
519 aa  634  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.739942  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4182  signal recognition particle protein  62.25 
 
 
535 aa  634  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  64.11 
 
 
527 aa  632  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645209  normal  0.354043 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1396  signal recognition particle protein  67.37 
 
 
521 aa  632  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.167047  decreased coverage  0.0064303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1147  signal recognition particle protein  71.69 
 
 
521 aa  634  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1301  signal recognition particle protein  72.17 
 
 
514 aa  632  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556432  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  62.85 
 
 
517 aa  629  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1165  signal recognition particle protein  62.87 
 
 
532 aa  625  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196377  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2181  signal recognition particle protein  62.78 
 
 
522 aa  627  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.374649  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  64.63 
 
 
522 aa  619  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2543  signal recognition particle protein  68.51 
 
 
528 aa  620  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.864266  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09140  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  69.25 
 
 
528 aa  609  1e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1959  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60.97 
 
 
520 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2005  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60.97 
 
 
520 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182683  normal  0.803066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1939  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60.97 
 
 
520 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778072  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12930  signal recognition particle protein ffh  69.78 
 
 
525 aa  601  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.569051 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2229  signal recognition particle protein  59.85 
 
 
527 aa  599  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10980  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  59.89 
 
 
604 aa  600  1e-170  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.160469  normal  0.0249025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2489  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  61.41 
 
 
529 aa  595  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.277512  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  62.97 
 
 
525 aa  594  1e-168  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3595  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  71.4 
 
 
517 aa  590  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09950  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  69 
 
 
530 aa  590  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0229355  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0328  signal recognition particle protein  65.84 
 
 
556 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.59605 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1050  signal recognition particle GTPase  63.66 
 
 
544 aa  560  1e-158  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  52.14 
 
 
444 aa  459  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.12 
 
 
447 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  52.41 
 
 
446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  52.44 
 
 
446 aa  449  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.34 
 
 
443 aa  452  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  53.23 
 
 
445 aa  450  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  53.54 
 
 
448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  51.74 
 
 
453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  51.85 
 
 
449 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  51.85 
 
 
449 aa  442  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  51.85 
 
 
449 aa  442  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  51.85 
 
 
449 aa  442  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  51.85 
 
 
449 aa  442  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50 
 
 
452 aa  443  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  52.08 
 
 
449 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  51.85 
 
 
449 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  52.31 
 
 
449 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  51.85 
 
 
449 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  51.62 
 
 
449 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  49.67 
 
 
449 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  51.62 
 
 
449 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  51.22 
 
 
444 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  51.04 
 
 
448 aa  442  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  51.85 
 
 
450 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  50.66 
 
 
452 aa  438  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  52.8 
 
 
469 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  51.33 
 
 
451 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.65 
 
 
447 aa  437  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.54 
 
 
446 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  49.78 
 
 
449 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  51.14 
 
 
453 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.21 
 
 
443 aa  432  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  50 
 
 
453 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  50.46 
 
 
455 aa  431  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  49.77 
 
 
492 aa  429  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  51.13 
 
 
449 aa  430  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  51.43 
 
 
459 aa  432  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1427  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.14 
 
 
458 aa  429  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0277163  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  50.11 
 
 
518 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.11 
 
 
481 aa  429  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  50.91 
 
 
453 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  48.64 
 
 
463 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0522  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.54 
 
 
450 aa  425  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.823996  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  51.65 
 
 
446 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  48.75 
 
 
458 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  49.45 
 
 
453 aa  425  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  48.91 
 
 
453 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  48.91 
 
 
453 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  48.91 
 
 
453 aa  422  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  48.45 
 
 
479 aa  423  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  48.91 
 
 
453 aa  422  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  48.91 
 
 
453 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  48.91 
 
 
453 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  52.74 
 
 
444 aa  423  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  48.75 
 
 
478 aa  424  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  48.91 
 
 
453 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0884  signal recognition particle protein  48.79 
 
 
453 aa  425  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138728  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.51 
 
 
454 aa  423  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  48.91 
 
 
453 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3365  signal recognition particle protein  48.57 
 
 
453 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.089536  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3230  signal recognition particle protein  48.79 
 
 
453 aa  425  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0218227  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  48.06 
 
 
520 aa  425  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>