More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1418 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1418  signal recognition particle protein  100 
 
 		 504 aa  984    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2779  Signal recognition particle protein  62.14 
 
 		 516 aa  608  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0765286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3578  signal recognition particle protein  61.97 
 
 		 511 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.715062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  64.11 
 
 		 515 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.600679 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1464  signal recognition particle protein  65.64 
 
 		 513 aa  588  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.517812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3351  signal recognition particle protein  67.13 
 
 		 551 aa  582  1.0000000000000001e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.31296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0353  signal recognition particle protein  63.15 
 
 		 514 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2887  signal recognition particle protein  65.98 
 
 		 522 aa  581  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0221  signal recognition particle protein  63.58 
 
 		 514 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115082  hitchhiker  0.0089568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0510  signal recognition particle protein  63.2 
 
 		 517 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0662  signal recognition particle protein  62.55 
 
 		 520 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3683  signal recognition particle protein  64.58 
 
 		 526 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0651  signal recognition particle protein  62.36 
 
 		 520 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0971217  normal  0.157335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0630  signal recognition particle protein  63 
 
 		 520 aa  565  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0246  signal recognition particle protein  63.15 
 
 		 516 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2983  signal recognition particle protein  60.69 
 
 		 540 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1184  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  65.44 
 
 		 504 aa  560  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1826  signal recognition particle protein  68.15 
 
 		 523 aa  555  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1758  signal recognition particle protein  68.15 
 
 		 523 aa  555  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3618  signal recognition particle protein  67.43 
 
 		 521 aa  553  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0128303 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0068  signal recognition particle protein  58.69 
 
 		 515 aa  543  1e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206889  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1404  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  63.03 
 
 		 491 aa  541  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294047  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2656  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  63.15 
 
 		 491 aa  534  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3341  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  69.09 
 
 		 522 aa  534  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1077  signal recognition particle protein  67.45 
 
 		 523 aa  534  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.624173  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0353  signal recognition particle protein  63.7 
 
 		 504 aa  532  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4073  signal recognition particle protein  66.98 
 
 		 525 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4203  signal recognition particle protein  68.38 
 
 		 526 aa  522  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1053  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  62.94 
 
 		 505 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2714  signal recognition particle protein  63.17 
 
 		 505 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  0.0233143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3750  signal recognition particle protein  66.98 
 
 		 527 aa  525  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3878  signal recognition particle protein  57.36 
 
 		 498 aa  522  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515054  normal  0.639996 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2728  signal recognition particle protein  62.33 
 
 		 484 aa  521  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2154  signal recognition particle protein  59.6 
 
 		 457 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.995378  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3095  signal recognition particle protein  66.98 
 
 		 514 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4887  signal recognition particle protein  60 
 
 		 511 aa  514  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3275  signal recognition particle protein  57.38 
 
 		 461 aa  502  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0976333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0176  signal recognition particle protein  58.24 
 
 		 501 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  59.87 
 
 		 501 aa  495  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2603  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60.08 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44624  hitchhiker  0.00700873 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2894  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60.79 
 
 		 521 aa  488  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.94 
 
 		 462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  53.01 
 
 		 448 aa  456  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  53.47 
 
 		 452 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.55 
 
 		 452 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  48.76 
 
 		 451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  50.74 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  50.91 
 
 		 515 aa  442  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  50.69 
 
 		 449 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  50.74 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  51.25 
 
 		 444 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  52.31 
 
 		 453 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  52.27 
 
 		 457 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  53.35 
 
 		 485 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  51.74 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  51.74 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  50.91 
 
 		 463 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  51.74 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  51.74 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  51.06 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  51.74 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  51.97 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  51.97 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  51.74 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  51.74 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  51.97 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  51.97 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1938  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.86 
 
 		 456 aa  435  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.55 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  51.74 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  51.74 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  51.26 
 
 		 453 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  51.97 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  51.15 
 
 		 453 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  51.51 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  51.51 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  51.51 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  51.28 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  51.51 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  51.51 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  48.88 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  48.88 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  49.04 
 
 		 467 aa  433  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  51.28 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3230  signal recognition particle protein  51.14 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0218227  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  52.07 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3365  signal recognition particle protein  51.14 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.089536  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  51.74 
 
 		 449 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  51.28 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.16 
 
 		 447 aa  432  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0884  signal recognition particle protein  51.14 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  51.26 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  50.92 
 
 		 446 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  51.28 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  51.75 
 
 		 457 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  51.51 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  49.04 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  50.88 
 
 		 457 aa  435  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  51.74 
 
 		 453 aa  430  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 515 aa  430  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>