More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3275 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3275  signal recognition particle protein  100 
 
 		 461 aa  907    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0976333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2154  signal recognition particle protein  75 
 
 		 457 aa  666    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.995378  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1184  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  61.47 
 
 		 504 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1418  signal recognition particle protein  60.47 
 
 		 504 aa  515  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2656  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  61.59 
 
 		 491 aa  513  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3618  signal recognition particle protein  61.5 
 
 		 521 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0128303 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1404  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  59.2 
 
 		 491 aa  508  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294047  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2887  signal recognition particle protein  61.73 
 
 		 522 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3351  signal recognition particle protein  59.67 
 
 		 551 aa  507  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.31296 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0630  signal recognition particle protein  62.7 
 
 		 520 aa  504  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0651  signal recognition particle protein  62.47 
 
 		 520 aa  501  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0971217  normal  0.157335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3683  signal recognition particle protein  62 
 
 		 526 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0662  signal recognition particle protein  62.24 
 
 		 520 aa  500  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2983  signal recognition particle protein  60.84 
 
 		 540 aa  491  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4887  signal recognition particle protein  57.82 
 
 		 511 aa  488  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2779  Signal recognition particle protein  56.88 
 
 		 516 aa  481  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0765286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1464  signal recognition particle protein  58.93 
 
 		 513 aa  478  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.517812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1053  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  57.51 
 
 		 505 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2714  signal recognition particle protein  57.75 
 
 		 505 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  0.0233143 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3578  signal recognition particle protein  56.18 
 
 		 511 aa  474  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.715062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  57.58 
 
 		 515 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.600679 
 
 
-
 
NC_004310  BR1826  signal recognition particle protein  59.06 
 
 		 523 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1758  signal recognition particle protein  59.29 
 
 		 523 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0353  signal recognition particle protein  56.78 
 
 		 504 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2728  signal recognition particle protein  58.18 
 
 		 484 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0353  signal recognition particle protein  58.66 
 
 		 514 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0246  signal recognition particle protein  58.66 
 
 		 516 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0221  signal recognition particle protein  57.04 
 
 		 514 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115082  hitchhiker  0.0089568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0510  signal recognition particle protein  58.89 
 
 		 517 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0068  signal recognition particle protein  56.59 
 
 		 515 aa  458  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206889  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  52.38 
 
 		 459 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  55.16 
 
 		 451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3095  signal recognition particle protein  60 
 
 		 514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2894  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  58.85 
 
 		 521 aa  454  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4073  signal recognition particle protein  59.53 
 
 		 525 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.19 
 
 		 452 aa  450  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3750  signal recognition particle protein  59.53 
 
 		 527 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2603  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.15 
 
 		 514 aa  450  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44624  hitchhiker  0.00700873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3341  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  59.53 
 
 		 522 aa  450  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1077  signal recognition particle protein  58.82 
 
 		 523 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.624173  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  53.05 
 
 		 453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  53.05 
 
 		 453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  53.05 
 
 		 453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  53.05 
 
 		 453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  53.05 
 
 		 453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4203  signal recognition particle protein  59.53 
 
 		 526 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  53.05 
 
 		 453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  52.4 
 
 		 457 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  53.05 
 
 		 453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  53.05 
 
 		 453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3878  signal recognition particle protein  55.82 
 
 		 498 aa  447  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515054  normal  0.639996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  53.05 
 
 		 453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  54.29 
 
 		 452 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  52.38 
 
 		 449 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  52.42 
 
 		 456 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  53.05 
 
 		 453 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  53.05 
 
 		 453 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  52.71 
 
 		 453 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0176  signal recognition particle protein  57.04 
 
 		 501 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.92 
 
 		 447 aa  444  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3515  signal recognition particle protein  51.66 
 
 		 455 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  53.05 
 
 		 453 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3094  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.67 
 
 		 463 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.724164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  53.05 
 
 		 453 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  52.18 
 
 		 457 aa  443  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  53.05 
 
 		 453 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  52.82 
 
 		 453 aa  438  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  50.79 
 
 		 463 aa  439  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  52.4 
 
 		 457 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2514  signal recognition particle protein  51.43 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3268  signal recognition particle protein  51.43 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3365  signal recognition particle protein  51.72 
 
 		 453 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.089536  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2134  signal recognition particle protein  53.19 
 
 		 449 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1149  signal recognition particle protein  51.43 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543894  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3230  signal recognition particle protein  51.72 
 
 		 453 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0218227  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0522  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.47 
 
 		 450 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3517  signal recognition particle protein  51.43 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0436  signal recognition particle protein  51.43 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0518  signal recognition particle protein  51.66 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.034328  normal  0.698536 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0884  signal recognition particle protein  51.72 
 
 		 453 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0493  signal recognition particle protein  51.66 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1048  signal recognition particle protein  52.62 
 
 		 457 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000196553  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3479  signal recognition particle protein  51.43 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1295  signal recognition particle protein  51.43 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.55 
 
 		 511 aa  437  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2947  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.68 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2793  signal recognition particle protein  51.43 
 
 		 455 aa  438  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3675  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.21 
 
 		 455 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.74 
 
 		 447 aa  436  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  51.38 
 
 		 515 aa  436  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  51.02 
 
 		 458 aa  435  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  51.73 
 
 		 458 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0560  signal recognition particle protein  51.21 
 
 		 455 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276011  hitchhiker  0.000299171 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2643  signal recognition particle protein  52.17 
 
 		 455 aa  438  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0590  signal recognition particle protein  51.21 
 
 		 455 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  51.73 
 
 		 458 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.61 
 
 		 462 aa  438  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  52.35 
 
 		 478 aa  435  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  50.88 
 
 		 453 aa  438  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  52.29 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>