121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5209 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5120  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  902    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5209  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  902    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5500  hypothetical protein  99.55 
 
 		 444 aa  897    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.595048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10128  hypothetical protein  65.11 
 
 		 455 aa  580  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5735  hypothetical protein  65.48 
 
 		 441 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1087  hypothetical protein  64.79 
 
 		 430 aa  568  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4102  putative pep2 protein  45.9 
 
 		 464 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0677  aminoglycoside phosphotransferase  44.44 
 
 		 454 aa  352  7e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0658207  normal  0.780936 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3680  putative pep2 protein  44.25 
 
 		 456 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6074  aminoglycoside phosphotransferase  44.3 
 
 		 442 aa  330  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858054  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3092  aminoglycoside phosphotransferase  43.52 
 
 		 472 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000153102  decreased coverage  0.000000269489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3585  aminoglycoside phosphotransferase  42.58 
 
 		 470 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8142  trehalose synthase  44.29 
 
 		 437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1050  hypothetical protein  43.86 
 
 		 462 aa  316  6e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0583  putative pep2 protein  39.06 
 
 		 469 aa  299  6e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2860  aminoglycoside phosphotransferase  41.4 
 
 		 455 aa  294  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1807  hypothetical protein  39.54 
 
 		 488 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.932272  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0247  aminoglycoside phosphotransferase  38.94 
 
 		 462 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1295  1,4-alpha-glucan branching enzyme  37.63 
 
 		 467 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  31.43 
 
 		 1119 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  32.02 
 
 		 1108 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  39.24 
 
 		 1320 aa  187  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1335  aminoglycoside phosphotransferase  34.01 
 
 		 472 aa  186  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  28.43 
 
 		 1100 aa  184  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  31.57 
 
 		 1240 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  32.14 
 
 		 1224 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  28.6 
 
 		 1098 aa  181  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  28.54 
 
 		 1116 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  31.14 
 
 		 1123 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  28.84 
 
 		 1116 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  30.14 
 
 		 1105 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  27.8 
 
 		 1098 aa  172  9e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  31.58 
 
 		 1110 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  28.43 
 
 		 1105 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26350  uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis  34.22 
 
 		 536 aa  168  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  29.09 
 
 		 1130 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  28.74 
 
 		 1113 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  29.25 
 
 		 1109 aa  167  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  30.62 
 
 		 1121 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  34.24 
 
 		 1109 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  30.95 
 
 		 1100 aa  160  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10320  uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis  35.31 
 
 		 520 aa  160  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  29.92 
 
 		 1115 aa  160  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  27.04 
 
 		 1099 aa  160  5e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1095  aminoglycoside phosphotransferase  33.11 
 
 		 428 aa  160  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0294686 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  27.39 
 
 		 1098 aa  159  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  32.07 
 
 		 1092 aa  156  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  29.03 
 
 		 1093 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  31.77 
 
 		 1113 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  28.16 
 
 		 1134 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2419  aminoglycoside phosphotransferase  34.45 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  31.67 
 
 		 1088 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  30.52 
 
 		 1112 aa  151  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0329  aminoglycoside phosphotransferase  30.06 
 
 		 485 aa  150  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  31.81 
 
 		 1102 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  30.14 
 
 		 1100 aa  150  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0399  trehalose synthase-fused maltokinase-like protein  29.6 
 
 		 558 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  28.77 
 
 		 1088 aa  149  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  31.23 
 
 		 1106 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  33.16 
 
 		 1099 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  31.23 
 
 		 1106 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  29.61 
 
 		 1061 aa  147  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  28.2 
 
 		 1131 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  28.2 
 
 		 1131 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  28.2 
 
 		 1131 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  28.2 
 
 		 1131 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  28.77 
 
 		 1131 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  28.77 
 
 		 1131 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  29.62 
 
 		 1101 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  32.4 
 
 		 1100 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  30.58 
 
 		 1088 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  30.02 
 
 		 1136 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  31 
 
 		 1088 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  30.31 
 
 		 1106 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  28.62 
 
 		 1164 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  28.62 
 
 		 1164 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  31.73 
 
 		 1121 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0211  hypothetical protein  28.77 
 
 		 525 aa  144  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 		 1138 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  31.76 
 
 		 1105 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  30.37 
 
 		 1137 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  32.96 
 
 		 1100 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  28.14 
 
 		 1088 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  28.54 
 
 		 1108 aa  143  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  29.39 
 
 		 1137 aa  143  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  31.16 
 
 		 1142 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  28.34 
 
 		 1108 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  32.61 
 
 		 1100 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  30.5 
 
 		 1102 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  30.03 
 
 		 1093 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  32.12 
 
 		 1100 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  30.91 
 
 		 1102 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  29.25 
 
 		 1137 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  29.25 
 
 		 1137 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  29.09 
 
 		 1160 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  26.06 
 
 		 1104 aa  137  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  28.6 
 
 		 1137 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  27.91 
 
 		 1154 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  27.47 
 
 		 1094 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  32.19 
 
 		 1152 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>