120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1295 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1295  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 467 aa  908    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  44.29 
 
 		 1240 aa  289  6e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1335  aminoglycoside phosphotransferase  43.82 
 
 		 472 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  42.41 
 
 		 1224 aa  282  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2860  aminoglycoside phosphotransferase  42.33 
 
 		 455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3680  putative pep2 protein  42 
 
 		 456 aa  263  6e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26350  uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis  42.86 
 
 		 536 aa  256  8e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0247  aminoglycoside phosphotransferase  40.65 
 
 		 462 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1050  hypothetical protein  40.43 
 
 		 462 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0583  putative pep2 protein  39.41 
 
 		 469 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10320  uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis  38.91 
 
 		 520 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8142  trehalose synthase  39.53 
 
 		 437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4102  putative pep2 protein  40.34 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0677  aminoglycoside phosphotransferase  38.54 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0658207  normal  0.780936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3585  aminoglycoside phosphotransferase  38.45 
 
 		 470 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1095  aminoglycoside phosphotransferase  40.48 
 
 		 428 aa  221  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0294686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6074  aminoglycoside phosphotransferase  37.26 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858054  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1087  hypothetical protein  38.34 
 
 		 430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1807  hypothetical protein  35.71 
 
 		 488 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.932272  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3092  aminoglycoside phosphotransferase  38.8 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000153102  decreased coverage  0.000000269489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5500  hypothetical protein  38.7 
 
 		 444 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.595048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10128  hypothetical protein  36.81 
 
 		 455 aa  209  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5120  hypothetical protein  38.46 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5209  hypothetical protein  38.46 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5735  hypothetical protein  40.05 
 
 		 441 aa  203  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2419  aminoglycoside phosphotransferase  38.71 
 
 		 436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  26.09 
 
 		 1098 aa  151  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  27.64 
 
 		 1100 aa  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  30.53 
 
 		 1100 aa  145  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  31.69 
 
 		 1101 aa  143  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  26.81 
 
 		 1113 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  32.21 
 
 		 1217 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  25.77 
 
 		 1098 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  26.4 
 
 		 1098 aa  132  9e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  30.72 
 
 		 1123 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  24.36 
 
 		 1105 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  28.27 
 
 		 1104 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  29.13 
 
 		 1109 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  32.09 
 
 		 1110 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  29.18 
 
 		 1139 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  32.02 
 
 		 1121 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  28.01 
 
 		 1108 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  31.35 
 
 		 1088 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  29.06 
 
 		 1115 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  30.67 
 
 		 1088 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  26.96 
 
 		 1119 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  33.94 
 
 		 1092 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  25.72 
 
 		 1105 aa  124  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  31.55 
 
 		 1088 aa  124  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0211  hypothetical protein  24.23 
 
 		 525 aa  123  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  31.66 
 
 		 1102 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  30.54 
 
 		 1088 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  31.63 
 
 		 1102 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  31.41 
 
 		 1102 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  29.92 
 
 		 1100 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  25.35 
 
 		 1099 aa  121  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  26.92 
 
 		 1116 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  33.78 
 
 		 1061 aa  120  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  30.08 
 
 		 1094 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  28.76 
 
 		 1113 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  26.62 
 
 		 1116 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  25.76 
 
 		 1106 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  33.25 
 
 		 1088 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01590  uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis  24.36 
 
 		 522 aa  114  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  29.84 
 
 		 1093 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  25.76 
 
 		 1106 aa  113  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0329  aminoglycoside phosphotransferase  28.08 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  26.23 
 
 		 1106 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  39.34 
 
 		 1109 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  27.37 
 
 		 1134 aa  110  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  29.09 
 
 		 1112 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  26.23 
 
 		 1105 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  29.4 
 
 		 1093 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  27.15 
 
 		 1108 aa  106  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  28.52 
 
 		 1108 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  27.76 
 
 		 1108 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0399  trehalose synthase-fused maltokinase-like protein  25.24 
 
 		 558 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  27.9 
 
 		 1152 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  30.67 
 
 		 1164 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  27.66 
 
 		 1100 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  30.67 
 
 		 1164 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  30.08 
 
 		 1100 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  28.97 
 
 		 1136 aa  99.8  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  24.32 
 
 		 1121 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  29.19 
 
 		 1099 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  28.57 
 
 		 1100 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  27.81 
 
 		 1131 aa  96.7  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  27.81 
 
 		 1131 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  27.69 
 
 		 1154 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  41.51 
 
 		 1088 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  24.14 
 
 		 1130 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  32.31 
 
 		 1100 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  33.89 
 
 		 1142 aa  95.1  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  29.54 
 
 		 1154 aa  94.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  26.7 
 
 		 1100 aa  94  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  32.59 
 
 		 1100 aa  94  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  27.54 
 
 		 1131 aa  93.6  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  27.54 
 
 		 1131 aa  93.6  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  27.54 
 
 		 1131 aa  93.6  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  27.54 
 
 		 1131 aa  93.6  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>