122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0399 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0399  trehalose synthase-fused maltokinase-like protein  100 
 
 		 558 aa  1153    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  31.83 
 
 		 1113 aa  292  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  31.94 
 
 		 1116 aa  277  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  32.2 
 
 		 1105 aa  277  3e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  32.47 
 
 		 1116 aa  276  9e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  34.39 
 
 		 1108 aa  270  5.9999999999999995e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  32.09 
 
 		 1098 aa  264  4e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  31.06 
 
 		 1105 aa  262  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  32.22 
 
 		 1217 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  30.77 
 
 		 1098 aa  249  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  29.55 
 
 		 1100 aa  249  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  30.09 
 
 		 1098 aa  247  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  32.02 
 
 		 1099 aa  247  4.9999999999999997e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  31.06 
 
 		 1112 aa  243  6e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  31.37 
 
 		 1109 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  31.25 
 
 		 1123 aa  239  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  31.53 
 
 		 1119 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  30.62 
 
 		 1111 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  29.74 
 
 		 1121 aa  231  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  30.57 
 
 		 1121 aa  224  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  30.98 
 
 		 1108 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  28.07 
 
 		 1114 aa  219  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  28.89 
 
 		 1130 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  31.57 
 
 		 1139 aa  214  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  31.71 
 
 		 1109 aa  213  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  30.59 
 
 		 1104 aa  211  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  31.19 
 
 		 1112 aa  209  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  29.64 
 
 		 1088 aa  209  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  28.76 
 
 		 1088 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  29.82 
 
 		 1092 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  30.19 
 
 		 1115 aa  207  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  28.36 
 
 		 1113 aa  207  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  29.98 
 
 		 1105 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  29.83 
 
 		 1106 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  29.17 
 
 		 1088 aa  204  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  29.17 
 
 		 1088 aa  203  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  30.8 
 
 		 1100 aa  203  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  31.52 
 
 		 1142 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  30.6 
 
 		 1102 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  29.83 
 
 		 1106 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  29.23 
 
 		 1106 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  30.04 
 
 		 1110 aa  200  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  29.87 
 
 		 1152 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  29.62 
 
 		 1121 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  29.87 
 
 		 1088 aa  196  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  29.64 
 
 		 1137 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  29.72 
 
 		 1108 aa  194  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  28.96 
 
 		 1102 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  29.98 
 
 		 1108 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  29.45 
 
 		 1137 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  29.83 
 
 		 1100 aa  192  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  28.77 
 
 		 1102 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  28.63 
 
 		 1154 aa  191  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  27.88 
 
 		 1131 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  29.11 
 
 		 1093 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  29.7 
 
 		 1137 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  28.17 
 
 		 1136 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  28.22 
 
 		 1093 aa  188  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  28.24 
 
 		 1154 aa  186  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  27.69 
 
 		 1131 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  27.69 
 
 		 1131 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  27.69 
 
 		 1131 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  27.69 
 
 		 1131 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  27.69 
 
 		 1131 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  28.03 
 
 		 1088 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  27.32 
 
 		 1110 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  28.26 
 
 		 1100 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  29.78 
 
 		 1100 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  30.36 
 
 		 1100 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  29.39 
 
 		 1100 aa  183  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  29.23 
 
 		 1137 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  29.23 
 
 		 1137 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  28.6 
 
 		 1094 aa  181  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  29.43 
 
 		 1100 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  27.66 
 
 		 1138 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  27.36 
 
 		 1108 aa  179  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1160 aa  177  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  28.07 
 
 		 1164 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  28.07 
 
 		 1164 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  27.21 
 
 		 1134 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  28.33 
 
 		 1100 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8142  trehalose synthase  30.57 
 
 		 437 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  28.1 
 
 		 1101 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  27.29 
 
 		 1099 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01590  uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis  28.82 
 
 		 522 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2860  aminoglycoside phosphotransferase  30.46 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  26.52 
 
 		 1101 aa  158  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  29.32 
 
 		 1061 aa  157  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  27.36 
 
 		 1095 aa  154  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0247  aminoglycoside phosphotransferase  28.99 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3585  aminoglycoside phosphotransferase  29.86 
 
 		 470 aa  152  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4102  putative pep2 protein  28.46 
 
 		 464 aa  150  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0677  aminoglycoside phosphotransferase  30.02 
 
 		 454 aa  150  8e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0658207  normal  0.780936 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0211  hypothetical protein  27.17 
 
 		 525 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1050  hypothetical protein  26.15 
 
 		 462 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10128  hypothetical protein  26.88 
 
 		 455 aa  143  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5500  hypothetical protein  29.6 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.595048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5120  hypothetical protein  29.6 
 
 		 444 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1807  hypothetical protein  28.24 
 
 		 488 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.932272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5209  hypothetical protein  29.6 
 
 		 444 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>