121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3585 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3585  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
470 aa  942    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0583  putative pep2 protein  50.62 
 
 
469 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2860  aminoglycoside phosphotransferase  50.65 
 
 
455 aa  410  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8142  trehalose synthase  49.13 
 
 
437 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0247  aminoglycoside phosphotransferase  47.66 
 
 
462 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0677  aminoglycoside phosphotransferase  47.1 
 
 
454 aa  364  1e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0658207  normal  0.780936 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3680  putative pep2 protein  47.51 
 
 
456 aa  358  9.999999999999999e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4102  putative pep2 protein  47.2 
 
 
464 aa  353  4e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6074  aminoglycoside phosphotransferase  45.34 
 
 
442 aa  332  7.000000000000001e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1050  hypothetical protein  47.61 
 
 
462 aa  332  9e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5120  hypothetical protein  42.23 
 
 
444 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5209  hypothetical protein  42.23 
 
 
444 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5500  hypothetical protein  42.01 
 
 
444 aa  326  7e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.595048  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3092  aminoglycoside phosphotransferase  43.78 
 
 
472 aa  322  9.000000000000001e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000153102  decreased coverage  0.000000269489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1087  hypothetical protein  43.2 
 
 
430 aa  319  6e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1807  hypothetical protein  43.42 
 
 
488 aa  319  7.999999999999999e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.932272  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10128  hypothetical protein  42.8 
 
 
455 aa  316  7e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5735  hypothetical protein  41.68 
 
 
441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139677  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1295  1,4-alpha-glucan branching enzyme  38.45 
 
 
467 aa  229  7e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1335  aminoglycoside phosphotransferase  36.02 
 
 
472 aa  204  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  35.84 
 
 
1224 aa  201  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  31.37 
 
 
1113 aa  194  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26350  uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis  36.47 
 
 
536 aa  192  7e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  39.37 
 
 
1320 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  33.93 
 
 
1240 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10320  uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis  32.16 
 
 
520 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  31.27 
 
 
1106 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  32.36 
 
 
1113 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1095  aminoglycoside phosphotransferase  32.42 
 
 
428 aa  169  9e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0294686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  31.08 
 
 
1106 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  30.68 
 
 
1106 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  31.41 
 
 
1100 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  29.14 
 
 
1119 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  31.53 
 
 
1105 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  31.07 
 
 
1108 aa  164  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  29.35 
 
 
1098 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  28.31 
 
 
1105 aa  160  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  29.4 
 
 
1123 aa  159  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2419  aminoglycoside phosphotransferase  36.47 
 
 
436 aa  159  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  30.49 
 
 
1112 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  27.55 
 
 
1100 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0399  trehalose synthase-fused maltokinase-like protein  29.86 
 
 
558 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  29.4 
 
 
1098 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  36.9 
 
 
1088 aa  154  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  28.44 
 
 
1109 aa  153  8e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  32.65 
 
 
1061 aa  152  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  32.23 
 
 
1100 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  30.1 
 
 
1093 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  28.65 
 
 
1130 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  29.27 
 
 
1105 aa  149  9e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  28.39 
 
 
1116 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.46 
 
 
1217 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  29.7 
 
 
1093 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  30.67 
 
 
1108 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  32.25 
 
 
1136 aa  147  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  36.06 
 
 
1088 aa  147  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  36.06 
 
 
1088 aa  146  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  31.4 
 
 
1100 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  28.12 
 
 
1116 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  30.33 
 
 
1137 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  31.84 
 
 
1102 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  30.33 
 
 
1137 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  31.84 
 
 
1102 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  31.25 
 
 
1110 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  30.37 
 
 
1108 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  30.82 
 
 
1142 aa  143  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  30.8 
 
 
1092 aa  143  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  31.66 
 
 
1100 aa  143  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  28.4 
 
 
1098 aa  142  9e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01590  uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis  26.75 
 
 
522 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  29.43 
 
 
1100 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  34.72 
 
 
1088 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  30.4 
 
 
1109 aa  140  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  28.02 
 
 
1134 aa  140  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  28.73 
 
 
1139 aa  139  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  30.26 
 
 
1121 aa  139  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  31.25 
 
 
1138 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  29.51 
 
 
1137 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  29.51 
 
 
1137 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  28.96 
 
 
1160 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  28.85 
 
 
1101 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  30.48 
 
 
1137 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  32.04 
 
 
1100 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  28.93 
 
 
1154 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  29.38 
 
 
1152 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  32.09 
 
 
1164 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  32.09 
 
 
1164 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  28.12 
 
 
1104 aa  137  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  28.73 
 
 
1121 aa  137  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  27.63 
 
 
1099 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  29.57 
 
 
1108 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  30.89 
 
 
1131 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  29.48 
 
 
1100 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  30.89 
 
 
1131 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  30.89 
 
 
1131 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  30.89 
 
 
1131 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  30.69 
 
 
1131 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  30.69 
 
 
1131 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  30.6 
 
 
1099 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  28.16 
 
 
1154 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>