121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6074 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6074  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 442 aa  882    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858054  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0677  aminoglycoside phosphotransferase  47.87 
 
 		 454 aa  364  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0658207  normal  0.780936 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3092  aminoglycoside phosphotransferase  45.97 
 
 		 472 aa  358  8e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000153102  decreased coverage  0.000000269489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1050  hypothetical protein  48.57 
 
 		 462 aa  358  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4102  putative pep2 protein  46.56 
 
 		 464 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0583  putative pep2 protein  45.57 
 
 		 469 aa  354  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2860  aminoglycoside phosphotransferase  46.95 
 
 		 455 aa  353  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10128  hypothetical protein  45.51 
 
 		 455 aa  347  3e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3680  putative pep2 protein  47.47 
 
 		 456 aa  344  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8142  trehalose synthase  46.19 
 
 		 437 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3585  aminoglycoside phosphotransferase  45.12 
 
 		 470 aa  330  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5120  hypothetical protein  43.62 
 
 		 444 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5209  hypothetical protein  43.62 
 
 		 444 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5500  hypothetical protein  43.4 
 
 		 444 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.595048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0247  aminoglycoside phosphotransferase  43.59 
 
 		 462 aa  312  6.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1087  hypothetical protein  42.44 
 
 		 430 aa  295  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5735  hypothetical protein  42.95 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1807  hypothetical protein  40.08 
 
 		 488 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.932272  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1295  1,4-alpha-glucan branching enzyme  37.26 
 
 		 467 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1095  aminoglycoside phosphotransferase  36.34 
 
 		 428 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0294686 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26350  uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis  41.03 
 
 		 536 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  37.57 
 
 		 1320 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1335  aminoglycoside phosphotransferase  37.46 
 
 		 472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2419  aminoglycoside phosphotransferase  32.96 
 
 		 436 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  32.42 
 
 		 1240 aa  170  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10320  uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis  36.09 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  31.11 
 
 		 1119 aa  167  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  31.47 
 
 		 1113 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  28.57 
 
 		 1113 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0329  aminoglycoside phosphotransferase  30.26 
 
 		 485 aa  162  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  34.07 
 
 		 1224 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  28.32 
 
 		 1098 aa  157  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  30.34 
 
 		 1101 aa  156  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  31.99 
 
 		 1116 aa  155  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  30.04 
 
 		 1106 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  29.73 
 
 		 1164 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  29.73 
 
 		 1164 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  33.06 
 
 		 1102 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  30.52 
 
 		 1106 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  31.93 
 
 		 1098 aa  151  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  29.25 
 
 		 1100 aa  150  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  31.84 
 
 		 1102 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  29.21 
 
 		 1106 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  32.08 
 
 		 1105 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  32.8 
 
 		 1116 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  31.84 
 
 		 1102 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  31.14 
 
 		 1061 aa  147  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  30.04 
 
 		 1100 aa  147  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  28.77 
 
 		 1100 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  32.78 
 
 		 1115 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  29.02 
 
 		 1099 aa  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  28.25 
 
 		 1093 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  28.65 
 
 		 1108 aa  144  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  29.04 
 
 		 1105 aa  144  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  27.44 
 
 		 1093 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  33.42 
 
 		 1121 aa  143  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  28.09 
 
 		 1105 aa  142  9e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.61 
 
 		 1217 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  28.57 
 
 		 1137 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  28.57 
 
 		 1137 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  29.92 
 
 		 1131 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  29.92 
 
 		 1131 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  29.73 
 
 		 1131 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  29.73 
 
 		 1131 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  29.73 
 
 		 1131 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  29.73 
 
 		 1131 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  28.43 
 
 		 1137 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  33.33 
 
 		 1112 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  29.57 
 
 		 1088 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  29.22 
 
 		 1138 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  29.78 
 
 		 1109 aa  137  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  29.41 
 
 		 1100 aa  136  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  29.41 
 
 		 1100 aa  136  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0399  trehalose synthase-fused maltokinase-like protein  27 
 
 		 558 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  32.08 
 
 		 1160 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  30.46 
 
 		 1098 aa  134  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  27.82 
 
 		 1137 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  31.68 
 
 		 1108 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  35.14 
 
 		 1109 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0211  hypothetical protein  25.8 
 
 		 525 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  27.36 
 
 		 1137 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  29.46 
 
 		 1110 aa  132  9e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  30.24 
 
 		 1108 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  33.07 
 
 		 1088 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  31.31 
 
 		 1100 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  30.3 
 
 		 1108 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  32.53 
 
 		 1088 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  32.53 
 
 		 1088 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  29.12 
 
 		 1136 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  32.05 
 
 		 1121 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  27.95 
 
 		 1123 aa  129  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  33.24 
 
 		 1142 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  33.8 
 
 		 1092 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  28.91 
 
 		 1152 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  27.29 
 
 		 1130 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  26.89 
 
 		 1134 aa  126  9e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  34.15 
 
 		 1100 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  29.27 
 
 		 1099 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  33.81 
 
 		 1088 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  33.33 
 
 		 1100 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>