122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0583 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0583  putative pep2 protein  100 
 
 		 469 aa  941    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0247  aminoglycoside phosphotransferase  56.34 
 
 		 462 aa  491  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2860  aminoglycoside phosphotransferase  51.97 
 
 		 455 aa  425  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8142  trehalose synthase  50.99 
 
 		 437 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3585  aminoglycoside phosphotransferase  51.44 
 
 		 470 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0677  aminoglycoside phosphotransferase  46.97 
 
 		 454 aa  393  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0658207  normal  0.780936 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3680  putative pep2 protein  49.79 
 
 		 456 aa  388  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1050  hypothetical protein  48.72 
 
 		 462 aa  373  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4102  putative pep2 protein  45.94 
 
 		 464 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6074  aminoglycoside phosphotransferase  45.99 
 
 		 442 aa  360  4e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858054  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3092  aminoglycoside phosphotransferase  44.21 
 
 		 472 aa  339  5e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000153102  decreased coverage  0.000000269489 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10128  hypothetical protein  40.88 
 
 		 455 aa  300  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5120  hypothetical protein  38.43 
 
 		 444 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5209  hypothetical protein  38.43 
 
 		 444 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5500  hypothetical protein  38.21 
 
 		 444 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.595048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1807  hypothetical protein  40.37 
 
 		 488 aa  291  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.932272  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1087  hypothetical protein  38.68 
 
 		 430 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5735  hypothetical protein  37.74 
 
 		 441 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1295  1,4-alpha-glucan branching enzyme  39.41 
 
 		 467 aa  252  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1335  aminoglycoside phosphotransferase  36.49 
 
 		 472 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  34.38 
 
 		 1240 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26350  uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis  34.82 
 
 		 536 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  37.57 
 
 		 1320 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  33.67 
 
 		 1224 aa  179  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  31.14 
 
 		 1109 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2419  aminoglycoside phosphotransferase  35.5 
 
 		 436 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  28.92 
 
 		 1098 aa  169  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  27.66 
 
 		 1100 aa  168  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  29.51 
 
 		 1119 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  31.53 
 
 		 1121 aa  163  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  28.78 
 
 		 1113 aa  163  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  33.59 
 
 		 1109 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  29.04 
 
 		 1104 aa  160  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1095  aminoglycoside phosphotransferase  32.51 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0294686 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  28.24 
 
 		 1098 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  27.95 
 
 		 1099 aa  156  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  29.3 
 
 		 1108 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  29.16 
 
 		 1113 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  30.83 
 
 		 1088 aa  154  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  29.9 
 
 		 1100 aa  153  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10320  uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis  35.64 
 
 		 520 aa  153  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  28.03 
 
 		 1098 aa  153  8e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  31.4 
 
 		 1061 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  30.63 
 
 		 1088 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  27.64 
 
 		 1130 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  30.41 
 
 		 1116 aa  149  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  30.44 
 
 		 1088 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  31.04 
 
 		 1102 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  30.39 
 
 		 1112 aa  144  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  27.91 
 
 		 1105 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  29.49 
 
 		 1116 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  28.27 
 
 		 1134 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  27.7 
 
 		 1106 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  28.32 
 
 		 1106 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  28.01 
 
 		 1139 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  30.1 
 
 		 1121 aa  140  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  30.38 
 
 		 1102 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  30.53 
 
 		 1102 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  27.84 
 
 		 1106 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  33.17 
 
 		 1142 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  29.16 
 
 		 1088 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0399  trehalose synthase-fused maltokinase-like protein  27.1 
 
 		 558 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  29.11 
 
 		 1100 aa  136  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.64 
 
 		 1217 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  28.66 
 
 		 1101 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  27.84 
 
 		 1154 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  25.94 
 
 		 1105 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  33.89 
 
 		 1092 aa  133  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  27.17 
 
 		 1093 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  29.25 
 
 		 1108 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  25.38 
 
 		 1105 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  27.67 
 
 		 1108 aa  131  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  27.91 
 
 		 1115 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  27.88 
 
 		 1154 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  31.64 
 
 		 1152 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  28.81 
 
 		 1108 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  32.05 
 
 		 1137 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  27.29 
 
 		 1123 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  32.33 
 
 		 1137 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  32.33 
 
 		 1137 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  29.83 
 
 		 1131 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  33.24 
 
 		 1100 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  27.87 
 
 		 1093 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  28.74 
 
 		 1108 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  30.92 
 
 		 1131 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  30.92 
 
 		 1131 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  30.92 
 
 		 1131 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  30.92 
 
 		 1131 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  32.97 
 
 		 1138 aa  127  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  29.83 
 
 		 1131 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  31.97 
 
 		 1137 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  31.69 
 
 		 1137 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  30.43 
 
 		 1088 aa  126  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  27.57 
 
 		 1100 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  29.83 
 
 		 1136 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  31.97 
 
 		 1100 aa  123  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0329  aminoglycoside phosphotransferase  29.48 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  31.02 
 
 		 1110 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  32.45 
 
 		 1164 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  32.45 
 
 		 1164 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>