121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3680 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3680  putative pep2 protein  100 
 
 		 456 aa  902    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1050  hypothetical protein  74.62 
 
 		 462 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0677  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0658207  normal  0.780936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0583  putative pep2 protein  49.47 
 
 		 469 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4102  putative pep2 protein  48.47 
 
 		 464 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3585  aminoglycoside phosphotransferase  47.29 
 
 		 470 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8142  trehalose synthase  46.15 
 
 		 437 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6074  aminoglycoside phosphotransferase  47.47 
 
 		 442 aa  344  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858054  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10128  hypothetical protein  46.14 
 
 		 455 aa  341  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2860  aminoglycoside phosphotransferase  44.97 
 
 		 455 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5120  hypothetical protein  44.25 
 
 		 444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5209  hypothetical protein  44.25 
 
 		 444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5500  hypothetical protein  44.25 
 
 		 444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.595048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3092  aminoglycoside phosphotransferase  44.42 
 
 		 472 aa  322  8e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000153102  decreased coverage  0.000000269489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0247  aminoglycoside phosphotransferase  44.06 
 
 		 462 aa  316  6e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1087  hypothetical protein  42.26 
 
 		 430 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1807  hypothetical protein  41.84 
 
 		 488 aa  295  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.932272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5735  hypothetical protein  41.59 
 
 		 441 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1295  1,4-alpha-glucan branching enzyme  42 
 
 		 467 aa  263  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  36.42 
 
 		 1240 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1335  aminoglycoside phosphotransferase  38.78 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  34.42 
 
 		 1320 aa  206  6e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  35.11 
 
 		 1224 aa  206  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26350  uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis  36.13 
 
 		 536 aa  189  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2419  aminoglycoside phosphotransferase  35.17 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  30.96 
 
 		 1109 aa  181  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10320  uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis  34.16 
 
 		 520 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1095  aminoglycoside phosphotransferase  36.42 
 
 		 428 aa  176  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0294686 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  31.33 
 
 		 1119 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  27.7 
 
 		 1098 aa  173  5.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  28.76 
 
 		 1100 aa  166  9e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  29.06 
 
 		 1098 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  29.41 
 
 		 1098 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  30.73 
 
 		 1108 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  27.31 
 
 		 1105 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  31.03 
 
 		 1110 aa  160  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  29.87 
 
 		 1106 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  29.68 
 
 		 1106 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  30.6 
 
 		 1100 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  28.33 
 
 		 1116 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  27.94 
 
 		 1105 aa  156  8e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  26.95 
 
 		 1116 aa  156  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  35.99 
 
 		 1121 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  28.91 
 
 		 1106 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  31.27 
 
 		 1137 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  27.2 
 
 		 1113 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  32.19 
 
 		 1101 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  27.05 
 
 		 1099 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0329  aminoglycoside phosphotransferase  27.63 
 
 		 485 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  33.46 
 
 		 1138 aa  153  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  32.74 
 
 		 1102 aa  153  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  31.14 
 
 		 1137 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  30.23 
 
 		 1137 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  27.76 
 
 		 1123 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  34.17 
 
 		 1102 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  33.66 
 
 		 1102 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  31.72 
 
 		 1105 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  29.92 
 
 		 1093 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  29.41 
 
 		 1100 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  30.75 
 
 		 1137 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  30.75 
 
 		 1137 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  35.62 
 
 		 1088 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  29.32 
 
 		 1139 aa  147  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  29.53 
 
 		 1113 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  30.61 
 
 		 1061 aa  146  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  35.6 
 
 		 1142 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  31.3 
 
 		 1092 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  29.15 
 
 		 1112 aa  143  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  30.43 
 
 		 1131 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  26.54 
 
 		 1130 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  28.65 
 
 		 1154 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  29.22 
 
 		 1115 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  30.36 
 
 		 1100 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  30.66 
 
 		 1108 aa  140  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  35.25 
 
 		 1121 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  30.57 
 
 		 1131 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  30.36 
 
 		 1100 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  28.86 
 
 		 1111 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  30.37 
 
 		 1131 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  30.37 
 
 		 1131 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  30.37 
 
 		 1131 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  30.37 
 
 		 1131 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  30.84 
 
 		 1093 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  29.35 
 
 		 1152 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0399  trehalose synthase-fused maltokinase-like protein  25.89 
 
 		 558 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  27.88 
 
 		 1154 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  30.97 
 
 		 1088 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  33.62 
 
 		 1112 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  30.89 
 
 		 1136 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  30.77 
 
 		 1088 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  30.16 
 
 		 1088 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  36.06 
 
 		 1109 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  30.59 
 
 		 1100 aa  134  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  27.68 
 
 		 1134 aa  132  9e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  26.94 
 
 		 1121 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  30.04 
 
 		 1108 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  26.93 
 
 		 1108 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01590  uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis  24.18 
 
 		 522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0211  hypothetical protein  26.83 
 
 		 525 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.15 
 
 		 1217 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>