128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1335 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1335  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
472 aa  918    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  42.83 
 
 
1224 aa  316  5e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  40.92 
 
 
1240 aa  294  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1295  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.03 
 
 
467 aa  291  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  47.31 
 
 
1320 aa  267  2.9999999999999995e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4102  putative pep2 protein  38.07 
 
 
464 aa  237  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26350  uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis  40.64 
 
 
536 aa  228  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3680  putative pep2 protein  38.78 
 
 
456 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1095  aminoglycoside phosphotransferase  41.42 
 
 
428 aa  226  7e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0294686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1050  hypothetical protein  38.63 
 
 
462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0583  putative pep2 protein  35.83 
 
 
469 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10320  uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis  36.25 
 
 
520 aa  211  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1807  hypothetical protein  34.52 
 
 
488 aa  209  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.932272  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0247  aminoglycoside phosphotransferase  36.44 
 
 
462 aa  206  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0677  aminoglycoside phosphotransferase  35.58 
 
 
454 aa  206  8e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0658207  normal  0.780936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2860  aminoglycoside phosphotransferase  35.6 
 
 
455 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3585  aminoglycoside phosphotransferase  35.5 
 
 
470 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3092  aminoglycoside phosphotransferase  35.43 
 
 
472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000153102  decreased coverage  0.000000269489 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10128  hypothetical protein  35.68 
 
 
455 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8142  trehalose synthase  34.85 
 
 
437 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2419  aminoglycoside phosphotransferase  45.02 
 
 
436 aa  192  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5120  hypothetical protein  33.26 
 
 
444 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5209  hypothetical protein  33.26 
 
 
444 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5735  hypothetical protein  36.41 
 
 
441 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139677  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5500  hypothetical protein  33.4 
 
 
444 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.595048  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1087  hypothetical protein  35.5 
 
 
430 aa  186  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6074  aminoglycoside phosphotransferase  34 
 
 
442 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858054  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  29.71 
 
 
1139 aa  139  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0329  aminoglycoside phosphotransferase  30.75 
 
 
485 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  33.94 
 
 
1088 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  32.64 
 
 
1088 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  30.33 
 
 
1119 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  32.38 
 
 
1088 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  29.46 
 
 
1115 aa  126  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  26.97 
 
 
1098 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  34.02 
 
 
1092 aa  123  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  28.68 
 
 
1110 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  32.9 
 
 
1121 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  28.61 
 
 
1105 aa  121  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  31.53 
 
 
1109 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  29.32 
 
 
1113 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  26.57 
 
 
1105 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  29.51 
 
 
1104 aa  120  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  33.67 
 
 
1121 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  32.07 
 
 
1217 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  26.86 
 
 
1109 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  31.12 
 
 
1100 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  32.77 
 
 
1061 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  29.1 
 
 
1108 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  29.82 
 
 
1100 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  28.25 
 
 
1112 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  25.23 
 
 
1116 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  29.55 
 
 
1100 aa  111  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0399  trehalose synthase-fused maltokinase-like protein  29.41 
 
 
558 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  31.28 
 
 
1108 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  30.49 
 
 
1100 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  29.57 
 
 
1100 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  30.05 
 
 
1093 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  25.45 
 
 
1116 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  30.29 
 
 
1100 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  31.49 
 
 
1137 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  31.49 
 
 
1137 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  30.64 
 
 
1100 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1605  hypothetical protein  47.83 
 
 
186 aa  109  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.638345  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  30.98 
 
 
1138 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  32.1 
 
 
1137 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  31.03 
 
 
1108 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  31.44 
 
 
1137 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  29.5 
 
 
1123 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  31.85 
 
 
1100 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  30.13 
 
 
1088 aa  106  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  31.6 
 
 
1137 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  28.08 
 
 
1164 aa  107  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  28.08 
 
 
1164 aa  107  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  32.32 
 
 
1160 aa  106  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  33.7 
 
 
1142 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  29.17 
 
 
1099 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  43.51 
 
 
1098 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  27.31 
 
 
1154 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  29.79 
 
 
1093 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  33.33 
 
 
1102 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  33.33 
 
 
1102 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  27.31 
 
 
1154 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2618  hypothetical protein  47.54 
 
 
209 aa  104  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  32.56 
 
 
1088 aa  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  32.57 
 
 
1101 aa  103  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  41.29 
 
 
1100 aa  103  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0083  hypothetical protein  54.39 
 
 
205 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  27.83 
 
 
1152 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  32.51 
 
 
1102 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  30.69 
 
 
1136 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  40.65 
 
 
1099 aa  100  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  30.86 
 
 
1106 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  27.71 
 
 
1108 aa  100  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  29.05 
 
 
1131 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  30.86 
 
 
1106 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  29.05 
 
 
1131 aa  99.8  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  29.05 
 
 
1131 aa  99.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  29.05 
 
 
1131 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01590  uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis  24.61 
 
 
522 aa  99.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>