121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26350 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_26350  uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis  100 
 
 		 536 aa  1025    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1295  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.06 
 
 		 467 aa  283  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  41 
 
 		 1320 aa  276  9e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1335  aminoglycoside phosphotransferase  41.1 
 
 		 472 aa  254  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4102  putative pep2 protein  37.55 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  46.09 
 
 		 1240 aa  221  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3680  putative pep2 protein  36.17 
 
 		 456 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  42.18 
 
 		 1224 aa  216  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3585  aminoglycoside phosphotransferase  36.49 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6074  aminoglycoside phosphotransferase  34.76 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0247  aminoglycoside phosphotransferase  37.45 
 
 		 462 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10128  hypothetical protein  35.46 
 
 		 455 aa  209  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0677  aminoglycoside phosphotransferase  35.06 
 
 		 454 aa  207  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0658207  normal  0.780936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0583  putative pep2 protein  35.95 
 
 		 469 aa  207  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8142  trehalose synthase  35.39 
 
 		 437 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1050  hypothetical protein  35.74 
 
 		 462 aa  194  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10320  uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis  39.06 
 
 		 520 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2860  aminoglycoside phosphotransferase  34.4 
 
 		 455 aa  187  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5120  hypothetical protein  37.83 
 
 		 444 aa  183  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5209  hypothetical protein  37.83 
 
 		 444 aa  183  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5500  hypothetical protein  37.83 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.595048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1087  hypothetical protein  33.54 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1807  hypothetical protein  32.41 
 
 		 488 aa  182  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.932272  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2419  aminoglycoside phosphotransferase  40.43 
 
 		 436 aa  180  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5735  hypothetical protein  34.39 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3092  aminoglycoside phosphotransferase  34.64 
 
 		 472 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000153102  decreased coverage  0.000000269489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1095  aminoglycoside phosphotransferase  43.52 
 
 		 428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0294686 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  32.71 
 
 		 1108 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  33.6 
 
 		 1119 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  33.88 
 
 		 1100 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  33.16 
 
 		 1110 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  30.13 
 
 		 1115 aa  134  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  30.66 
 
 		 1164 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  30.66 
 
 		 1164 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0329  aminoglycoside phosphotransferase  29.69 
 
 		 485 aa  130  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  32.11 
 
 		 1108 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  32.08 
 
 		 1113 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  32.91 
 
 		 1100 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  33.7 
 
 		 1109 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  34.36 
 
 		 1160 aa  127  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  33.51 
 
 		 1100 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  36.34 
 
 		 1088 aa  126  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  36.34 
 
 		 1088 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  34.44 
 
 		 1092 aa  125  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  30.87 
 
 		 1101 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  25.93 
 
 		 1113 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  35.52 
 
 		 1102 aa  124  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  26.44 
 
 		 1098 aa  123  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  30.59 
 
 		 1139 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  29.36 
 
 		 1100 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  34.97 
 
 		 1102 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  33.84 
 
 		 1217 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  35.33 
 
 		 1088 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  33.88 
 
 		 1108 aa  121  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  25.77 
 
 		 1105 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  29.18 
 
 		 1098 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  33.43 
 
 		 1100 aa  118  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  30.21 
 
 		 1108 aa  118  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  35.93 
 
 		 1088 aa  118  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  25.98 
 
 		 1100 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  28.33 
 
 		 1100 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01590  uncharacterized protein, probably involved in trehalose biosynthesis  26.85 
 
 		 522 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  31.44 
 
 		 1109 aa  117  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  28.75 
 
 		 1094 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  27.99 
 
 		 1100 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  30.65 
 
 		 1121 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  35.6 
 
 		 1102 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  27.83 
 
 		 1105 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  30.71 
 
 		 1154 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  27.73 
 
 		 1106 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  25.27 
 
 		 1098 aa  114  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  26.62 
 
 		 1105 aa  113  7.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  30.76 
 
 		 1131 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  28.49 
 
 		 1099 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  31.23 
 
 		 1154 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  30.76 
 
 		 1131 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  30.76 
 
 		 1131 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  30.76 
 
 		 1131 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  30.76 
 
 		 1131 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  32.28 
 
 		 1061 aa  113  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  32.43 
 
 		 1093 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  30.76 
 
 		 1131 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  32.3 
 
 		 1104 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  29.41 
 
 		 1116 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  31.69 
 
 		 1093 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  30.31 
 
 		 1116 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  30.08 
 
 		 1106 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  33.07 
 
 		 1137 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  33.07 
 
 		 1137 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  31.59 
 
 		 1123 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  29.95 
 
 		 1106 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  28.84 
 
 		 1112 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  32.04 
 
 		 1152 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  28.5 
 
 		 1137 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  26.77 
 
 		 1088 aa  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  32.62 
 
 		 1136 aa  107  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  28.19 
 
 		 1099 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  30.42 
 
 		 1121 aa  105  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  29.67 
 
 		 1137 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  29.55 
 
 		 1100 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>