More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2001 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 260 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1563  short-chain alcohol dehydrogenase  63.46 
 
 		 266 aa  323  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.63 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115705  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 		 277 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1939  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 250 aa  175  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 		 272 aa  171  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0477123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.46 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 280 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  37.75 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.092297  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 246 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 		 272 aa  158  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0224  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  37.8 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.03 
 
 		 246 aa  158  8e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 280 aa  158  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.16 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.4 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.03 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10784  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.9 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2281  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 		 257 aa  155  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 		 254 aa  155  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.25 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 		 282 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 252 aa  152  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 		 282 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 		 282 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 250 aa  152  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0524  short chain dehydrogenase  39.39 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.95 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.93 
 
 		 247 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 277 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.23 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.71 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 276 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 256 aa  148  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  38.31 
 
 		 255 aa  148  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 262 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  40.32 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 280 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4255  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  39.43 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.337254  normal  0.605714 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 295 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0283  short chain dehydrogenase  39.16 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.879782  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0246  short chain dehydrogenase  39.16 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0943  short chain dehydrogenase  39.16 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.8 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2511  short chain dehydrogenase  39.16 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1430  short chain dehydrogenase  39.16 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1627  short chain dehydrogenase  39.16 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2649  short chain dehydrogenase  39.16 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 251 aa  145  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2957  putative short-chain dehydrogenase/reductase  39.69 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  35.86 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>