More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1534 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
275 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
275 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254503  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
277 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 
272 aa  179  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1939  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
266 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337839  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 
272 aa  179  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  39.25 
 
 
272 aa  175  9e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.67 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.63 
 
 
269 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115705  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0642  putative short-chain dehydrogenase/reductase  40.29 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.0990143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1563  short-chain alcohol dehydrogenase  38.49 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147181  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  39.31 
 
 
255 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
273 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  38.85 
 
 
258 aa  156  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
280 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
266 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.388787  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 
280 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00370  fatty acid beta-oxidation-related protein, putative  35.29 
 
 
292 aa  154  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.170907  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
251 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
246 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
260 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1634  short chain dehydrogenase  40.47 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213832  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 
257 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 
257 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 
257 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  37.84 
 
 
259 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 
280 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  37.26 
 
 
257 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
256 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
257 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  37.79 
 
 
254 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
246 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.74 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2281  short chain dehydrogenase  36.12 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.13 
 
 
246 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.593617  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 
255 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
250 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 
249 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  36.05 
 
 
257 aa  142  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.55 
 
 
244 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.59 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.61 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0994  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.77 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.931337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.71 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.94 
 
 
250 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
246 aa  139  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  35.74 
 
 
252 aa  139  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
256 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.186116 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
250 aa  139  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.02 
 
 
248 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3384  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 
257 aa  138  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.43 
 
 
252 aa  138  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
280 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
272 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0477123  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
254 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
272 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.24 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
252 aa  136  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.85 
 
 
246 aa  136  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
249 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.24 
 
 
246 aa  135  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4649  short chain dehydrogenase  34.35 
 
 
261 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.07 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
254 aa  135  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4933  short chain dehydrogenase  39.03 
 
 
262 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.545921 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5530  short chain dehydrogenase  39.25 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  33.2 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  37.21 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1800  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.837228 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.18 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4559  short chain dehydrogenase  38.95 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3804  short chain dehydrogenase  38.95 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3720  short chain dehydrogenase  38.95 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0906259  normal  0.2081 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3706  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 
262 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
251 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2292  short chain dehydrogenase  37.64 
 
 
262 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.295109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.43 
 
 
246 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
250 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
251 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.38 
 
 
239 aa  132  6e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
255 aa  132  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 
255 aa  132  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.72 
 
 
247 aa  132  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.86 
 
 
249 aa  132  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.63 
 
 
248 aa  132  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
267 aa  132  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
264 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
264 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
254 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>