More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4234 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4234  histone-like DNA-binding protein  100 
 
 		 92 aa  177  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.482395  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9178  HNS-type DNA binding protein  77.17 
 
 		 92 aa  137  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.654708  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0009  histone-like DNA-binding protein  77.17 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8027  HNS-type DNA binding protein  74.73 
 
 		 92 aa  132  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4761  histone family protein DNA-binding protein  71.43 
 
 		 92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00588654  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7042  HNS-type DNA binding protein  71.43 
 
 		 92 aa  123  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.815664  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5718  histone family protein DNA-binding protein  69.23 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0779514  normal  0.621503 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8123  HNS-type DNA binding protein  69.23 
 
 		 92 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.029087  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6198  histone family protein DNA-binding protein  65.93 
 
 		 92 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0309609  normal  0.013935 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1217  histone-like DNA-binding protein  66.67 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.778852  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5182  histone family protein DNA-binding protein  56.52 
 
 		 92 aa  98.2  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.022675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2632  histone-like DNA-binding protein  59.77 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1806  histone family protein DNA-binding protein  54.35 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2320  histone family protein DNA-binding protein  56.32 
 
 		 91 aa  93.6  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313993 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5141  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.467193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2219  histone family protein DNA-binding protein  52.17 
 
 		 92 aa  90.9  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.789532  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  45.56 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1118  HU family DNA-binding protein  46.51 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2302  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2356  histone family protein DNA-binding protein  41.38 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  43.33 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1872  histone family protein DNA-binding protein  42.39 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  43.33 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  45.45 
 
 		 91 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  44.83 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2903  histone family protein DNA-binding protein  40.23 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00933352  normal  0.626047 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1870  histone family protein DNA-binding protein  44.19 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130937 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  45.98 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3742  integration host factor, alpha subunit  42.39 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  0.554438 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  41.3 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  41.3 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1538  DNA-binding protein HU  45.35 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000676058  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  41.3 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1251  histone family protein DNA-binding protein  40.23 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0902596  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0835  integration host factor, alpha subunit  38.37 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  48.15 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1004  integration host factor, alpha subunit  37.08 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  40.66 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1250  histone family protein DNA-binding protein  42.05 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2224  histone family protein DNA-binding protein  41.76 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000923552 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1362  histone-like DNA-binding protein  43.68 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1996  histone family protein DNA-binding protein  41.76 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  44.32 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  42.35 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl201  histone-like DNA-binding protein  41.86 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.25153  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2608  integration host factor, alpha subunit  41.38 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2237  integration host factor, alpha subunit  41.38 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0376768 
 
 
-
 
NC_004310  BR1105  DNA-binding protein HU  44.32 
 
 		 91 aa  67  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  42.53 
 
 		 92 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4242  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 93 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  43.68 
 
 		 90 aa  67  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  40.66 
 
 		 99 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2622  histone family protein DNA-binding protein  40.22 
 
 		 92 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2120  integration host factor, alpha subunit  38.46 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0975  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0875  histone family protein DNA-binding protein  41.38 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.757232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0981  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3836  nucleoid protein Hbs  42.35 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00753337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4401  nucleoid protein HU alpha subunit  40.7 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.177499 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3754  histone family protein DNA-binding protein  38.46 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.159868  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2824  nucleoid protein Hbs  41.38 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.669113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2054  histone family protein DNA-binding protein  41.38 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333504  normal  0.0104655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1013  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  43.33 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  43.02 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1865  integration host factor subunit alpha  40.24 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1888  histone family protein DNA-binding protein  39.56 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000630839  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2087  integration host factor subunit alpha  40.24 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1902  integration host factor subunit alpha  40.24 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0180  histone family protein DNA-binding protein  37.36 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1424  integration host factor, alpha subunit  37.36 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000184784  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1909  integration host factor subunit alpha  40.24 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000003309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2417  integration host factor subunit alpha  40.24 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000508912  hitchhiker  0.0000292071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1875  integration host factor subunit alpha  40.24 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00111351  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1830  integration host factor subunit alpha  40.24 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00321456  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16074  predicted protein  40.24 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.73937  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  42.53 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1810  integration host factor subunit alpha  40.24 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2167  integration host factor subunit alpha  40.24 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0460926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1341  histone family protein DNA-binding protein  40.91 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  42.35 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0532  histone-like protein  41.18 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  42.35 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  42.35 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  42.35 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  40.23 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  40.23 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  42.35 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5600  nucleoid protein HU alpha subunit  39.53 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3758  histone family protein DNA-binding protein  41.18 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.639339  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  42.35 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  42.35 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  40.23 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  42.35 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  42.35 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  42.35 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  40.23 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2207  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  42.35 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>