More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2219 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2219  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 92 aa  178  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.789532  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5182  histone family protein DNA-binding protein  90.22 
 
 		 92 aa  166  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.022675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1806  histone family protein DNA-binding protein  90.22 
 
 		 92 aa  162  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2320  histone family protein DNA-binding protein  64.13 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313993 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0009  histone-like DNA-binding protein  58.7 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6198  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 		 92 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0309609  normal  0.013935 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9178  HNS-type DNA binding protein  53.26 
 
 		 92 aa  100  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.654708  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4761  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 92 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00588654  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8027  HNS-type DNA binding protein  51.09 
 
 		 92 aa  99.4  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2632  histone-like DNA-binding protein  59.78 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5718  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 92 aa  97.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0779514  normal  0.621503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1217  histone-like DNA-binding protein  59.78 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.778852  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8123  HNS-type DNA binding protein  53.85 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.029087  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7042  HNS-type DNA binding protein  53.85 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.815664  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1538  DNA-binding protein HU  52.75 
 
 		 91 aa  88.2  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000676058  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4159  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 91 aa  87  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0576  histone family protein DNA-binding protein  50.55 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5141  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 92 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.467193 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4234  histone-like DNA-binding protein  52.17 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.482395  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1251  histone family protein DNA-binding protein  50.6 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0902596  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2903  histone family protein DNA-binding protein  50.6 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00933352  normal  0.626047 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2054  histone family protein DNA-binding protein  51.09 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333504  normal  0.0104655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  50.55 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2824  nucleoid protein Hbs  51.09 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.669113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  49.45 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2889  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2570  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153963  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  50.55 
 
 		 91 aa  80.1  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  48.35 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  47.78 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  47.78 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3723  DNA-binding protein HU-beta  48.35 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1750  histone-like DNA-binding protein  48.35 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.519537  normal  0.0235988 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3694  nucleoid protein HU beta subunit  48.35 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.566059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4266  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_28  DNA-binding protein HU-alpha  47.25 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3218  DNA-binding protein HU alpha subunit  46.15 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.585838 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  51.65 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0219  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.132966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4448  transcriptional regulator HU subunit alpha  45.56 
 
 		 90 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.302586  hitchhiker  0.00101008 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03877  HU, DNA-binding transcriptional regulator, alpha subunit  45.56 
 
 		 90 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.380115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3994  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4682  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 92 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0505442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4234  transcriptional regulator HU subunit alpha  45.56 
 
 		 90 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4025  transcriptional regulator HU subunit alpha  45.56 
 
 		 90 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0158227 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4491  transcriptional regulator HU subunit alpha  45.56 
 
 		 90 aa  76.6  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0852675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4543  transcriptional regulator HU subunit alpha  45.56 
 
 		 90 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.440082  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5469  transcriptional regulator HU subunit alpha  45.56 
 
 		 90 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.129609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03830  hypothetical protein  45.56 
 
 		 90 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.485291  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0956  DNA-binding protein HU-alpha  47.25 
 
 		 92 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3302  histone family protein DNA-binding protein  47.56 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4414  transcriptional regulator HU subunit alpha  45.56 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.18011  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00213  DNA-binding protein  45.05 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl201  histone-like DNA-binding protein  42.86 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.25153  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4577  transcriptional regulator HU subunit alpha  45.56 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511964 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4381  transcriptional regulator HU subunit alpha  45.56 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.842423 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1035  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00000557803  hitchhiker  0.00000000462139 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4503  transcriptional regulator HU subunit alpha  45.56 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0164141 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  47.25 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  46.15 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0914  DNA-binding protein HU  45.05 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.196839  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4501  transcriptional regulator HU subunit alpha  45.56 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.358882  normal  0.0495174 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3710  transcriptional regulator HU subunit alpha  46.67 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273113  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3864  transcriptional regulator HU subunit alpha  45.56 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78216  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2650  DNA-binding protein HU  47.78 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  47.25 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  47.25 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2846  DNA-binding protein HU-alpha  45.05 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  48.91 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  47.25 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1118  HU family DNA-binding protein  47.25 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  44.44 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  47.25 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  47.25 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  47.25 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1546  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.0402e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  48.31 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>