More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5182 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5182  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 92 aa  178  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.022675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2219  histone family protein DNA-binding protein  90.22 
 
 		 92 aa  166  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.789532  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1806  histone family protein DNA-binding protein  88.04 
 
 		 92 aa  162  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0009  histone-like DNA-binding protein  60.87 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2320  histone family protein DNA-binding protein  63.04 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313993 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9178  HNS-type DNA binding protein  58.7 
 
 		 92 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.654708  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5718  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 92 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0779514  normal  0.621503 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6198  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0309609  normal  0.013935 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4761  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00588654  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2632  histone-like DNA-binding protein  60.87 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8027  HNS-type DNA binding protein  55.43 
 
 		 92 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1217  histone-like DNA-binding protein  57.61 
 
 		 91 aa  98.6  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.778852  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8123  HNS-type DNA binding protein  54.95 
 
 		 92 aa  96.7  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.029087  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7042  HNS-type DNA binding protein  54.95 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.815664  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4234  histone-like DNA-binding protein  56.52 
 
 		 92 aa  92.8  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.482395  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5141  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.467193 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1538  DNA-binding protein HU  50.55 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000676058  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  50.55 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2889  histone-like DNA-binding protein  53.66 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0576  histone family protein DNA-binding protein  50.55 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2570  histone-like DNA-binding protein  53.66 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153963  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  49.45 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4159  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00213  DNA-binding protein  47.25 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  51.69 
 
 		 91 aa  80.1  0.000000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3302  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3723  DNA-binding protein HU-beta  49.45 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 91 aa  80.1  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1750  histone-like DNA-binding protein  49.45 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.519537  normal  0.0235988 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  49.45 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3694  nucleoid protein HU beta subunit  49.45 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.566059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  51.65 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4682  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0505442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2903  histone family protein DNA-binding protein  45.78 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00933352  normal  0.626047 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002182  DNA-binding protein HU-alpha  47.25 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131368  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  48.35 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2397  histone-like DNA-binding protein  51.22 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.806116  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0956  DNA-binding protein HU-alpha  48.35 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2846  DNA-binding protein HU-alpha  47.25 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2054  histone family protein DNA-binding protein  48.91 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333504  normal  0.0104655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2824  nucleoid protein Hbs  48.91 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.669113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  49.44 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1251  histone family protein DNA-binding protein  45.78 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0902596  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_004310  BR1105  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  46.67 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  46.67 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0920  histone family protein DNA-binding protein  49.43 
 
 		 87 aa  78.2  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.417728  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7326  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  50.55 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4266  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_28  DNA-binding protein HU-alpha  47.25 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2063  HU family DNA-binding protein  46.74 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.832344  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  47.19 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  45.56 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  45.05 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  49.44 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  47.83 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3218  DNA-binding protein HU alpha subunit  47.25 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.585838 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  45.05 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2337  histone-like DNA-binding protein  46.15 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000498066  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  47.25 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  45.05 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  47.25 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3758  histone family protein DNA-binding protein  45.12 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.639339  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2223  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167078  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4704  histone-like DNA-binding protein  45.05 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2379  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.18589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  47.25 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0839  histone family protein DNA-binding protein  50.55 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0237084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  47.25 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  47.25 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1488  histone-like DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0532  histone-like protein  46.67 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0219  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.132966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>