More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0920 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0920  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 87 aa  170  6.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.417728  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3327  histone family protein DNA-binding protein  75.86 
 
 		 94 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.372094  normal  0.0697763 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  67.44 
 
 		 91 aa  110  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  62.79 
 
 		 91 aa  107  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0045  histone family protein DNA-binding protein  58.14 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  61.63 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1362  histone-like DNA-binding protein  60.47 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  62.79 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  62.79 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  61.18 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  61.18 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  61.18 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  61.18 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  61.18 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  61.18 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  61.18 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  61.18 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  61.18 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  61.18 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  61.18 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1251  histone family protein DNA-binding protein  59.26 
 
 		 91 aa  97.4  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0902596  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2903  histone family protein DNA-binding protein  59.26 
 
 		 91 aa  97.4  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00933352  normal  0.626047 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5600  nucleoid protein HU alpha subunit  56.98 
 
 		 91 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48480  histone-like DNA-binding protein  54.65 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.707299  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4401  nucleoid protein HU alpha subunit  56.98 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.177499 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  57.65 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5472  DNA-binding protein HU family  53.49 
 
 		 111 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1118  HU family DNA-binding protein  60.49 
 
 		 91 aa  94.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6125  putative DNA-binding protein  53.49 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5027  histone-like DNA-binding protein  53.49 
 
 		 91 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.705107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  56.98 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  55.29 
 
 		 91 aa  94  6e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  58.14 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  56.98 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  55.29 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  56.47 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70600  HU family DNA-binding protein  53.49 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  56.98 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  55.81 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  58.82 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1051  histone family protein DNA-binding protein  52.44 
 
 		 89 aa  92  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000497636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  59.3 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  55.95 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2014  histone family protein DNA-binding protein  53.49 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000105311  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  55.81 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0548  HU family DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  53.49 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0658  histone-like DNA-binding protein  51.16 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  54.12 
 
 		 94 aa  90.5  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  54.12 
 
 		 94 aa  90.5  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1105  DNA-binding protein HU  55.81 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  55.81 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  55.81 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5361  histone family protein DNA-binding protein  54.65 
 
 		 101 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322215 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  53.49 
 
 		 90 aa  90.1  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1714  DNA-binding protein HU-beta  51.16 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.606946  normal  0.0324854 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  52.33 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4266  histone family protein DNA-binding protein  52.33 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00392  HU, DNA-binding transcriptional regulator, beta subunit  52.94 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1250  histone family protein DNA-binding protein  51.16 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  52.94 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0507  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0267079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1341  histone family protein DNA-binding protein  51.16 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  54.12 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  52.94 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0493  transcriptional regulator HU subunit beta  52.94 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  54.12 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  52.94 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3761  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.768478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0510  transcriptional regulator HU subunit beta  52.94 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0491  transcriptional regulator HU subunit beta  52.94 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0126716  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  52.94 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  52.94 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0554  transcriptional regulator HU subunit beta  52.94 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00736621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3836  nucleoid protein Hbs  56.47 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00753337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  52.94 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  55.29 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3817  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  52.94 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  52.94 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0548  histone family protein DNA-binding protein  48.84 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3943  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3325  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  54.12 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2054  histone family protein DNA-binding protein  56.79 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333504  normal  0.0104655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2824  nucleoid protein Hbs  56.79 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.669113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  52.94 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_28  DNA-binding protein HU-alpha  53.49 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1633  histone family protein DNA-binding protein  47.67 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  55.81 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  48.84 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  54.12 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0875  histone family protein DNA-binding protein  53.49 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.757232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43920  histone-like DNA-binding protein  53.49 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2292  nucleoid protein Hbs  48.84 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  52.94 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0547  histone family protein DNA-binding protein  48.84 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1014  histone family protein DNA-binding protein  48.84 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>