More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3327 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3327  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 94 aa  185  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.372094  normal  0.0697763 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0920  histone family protein DNA-binding protein  75.86 
 
 		 87 aa  127  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.417728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  62.22 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 91 aa  99.4  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1362  histone-like DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0875  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.757232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0045  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1341  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1250  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1051  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000497636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  55.68 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  56.82 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0219  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.132966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0550  DNA-binding protein HU-beta  51.11 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  47.78 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0576  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  47.78 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  53.33 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 91 aa  90.9  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4401  nucleoid protein HU alpha subunit  52.22 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.177499 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  48.89 
 
 		 126 aa  90.1  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  48.89 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  48.89 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  48.89 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  47.78 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4266  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  48.89 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  48.89 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  56.82 
 
 		 91 aa  89.4  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  48.89 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 92 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1105  DNA-binding protein HU  51.11 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5600  nucleoid protein HU alpha subunit  51.11 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 		 92 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  54.44 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  47.78 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 		 92 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 92 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 92 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 92 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 92 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2026  histone family protein DNA-binding protein  47.31 
 
 		 106 aa  88.6  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000760647  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  49.43 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_008789  Hhal_0600  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0791658  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1743  histone family protein DNA-binding protein  47.31 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6125  putative DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  47.78 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  47.78 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  53.33 
 
 		 96 aa  87  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 92 aa  87  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3836  nucleoid protein Hbs  50.56 
 
 		 91 aa  87  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00753337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 95 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  47.78 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3249  histone-like DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  51.11 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0658  histone-like DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70600  HU family DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  54.55 
 
 		 91 aa  86.7  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48480  histone-like DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.707299  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5313  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0463079 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1674  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.171237 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5222  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7326  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2337  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000498066  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1412  histone-like DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000277772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3758  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.639339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>