More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0045 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0045  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 90 aa  181  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1362  histone-like DNA-binding protein  78.89 
 
 		 90 aa  147  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  77.78 
 
 		 90 aa  144  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  68.89 
 
 		 91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  67.78 
 
 		 91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  65.17 
 
 		 90 aa  120  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  62.92 
 
 		 90 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  61.8 
 
 		 90 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  61.8 
 
 		 90 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  61.8 
 
 		 90 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  61.8 
 
 		 90 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  61.8 
 
 		 90 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  61.8 
 
 		 90 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  61.8 
 
 		 90 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  61.8 
 
 		 90 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  61.8 
 
 		 90 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  62.22 
 
 		 90 aa  115  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  61.8 
 
 		 90 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  61.8 
 
 		 90 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  62.5 
 
 		 91 aa  113  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  62.22 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0875  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  110  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.757232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  60.23 
 
 		 91 aa  110  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1341  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 91 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1105  DNA-binding protein HU  61.11 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1250  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  60.23 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2014  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  107  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000105311  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  56.67 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  60 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1956  nucleoid protein Hbs  56.67 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.582961  normal  0.45981 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  57.3 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0532  histone-like protein  58.43 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0920  histone family protein DNA-binding protein  58.14 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.417728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  57.3 
 
 		 96 aa  104  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  57.3 
 
 		 94 aa  104  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43920  histone-like DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  57.3 
 
 		 94 aa  104  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  56.67 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1909  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3493  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.175993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41210  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0758892  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  55.06 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  55.06 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 91 aa  103  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1789  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1674  histone-like DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.171237 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3065  nucleoid protein Hbs  55.56 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135138  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2303  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0561689  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2063  HU family DNA-binding protein  53.33 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.832344  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3466  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360259  hitchhiker  0.000212777 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1666  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  57.95 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1633  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1905  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173408  hitchhiker  0.000216257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2053  nucleoid protein HU beta subunit  55.56 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000457213  normal  0.0670315 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0083  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  56.18 
 
 		 90 aa  102  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0184  DNA-binding protein HU 1  56.18 
 
 		 90 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1745  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.693876  hitchhiker  0.00044049 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 91 aa  101  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 95 aa  100  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23600  histone-like DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4704  histone-like DNA-binding protein  53.33 
 
 		 93 aa  100  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 92 aa  100  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  54.44 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2292  nucleoid protein Hbs  55.56 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1014  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  55.56 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1187  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  51.11 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1412  histone-like DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  99.4  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000277772  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>