More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1514 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  176  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  64.84 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  61.54 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 		 91 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  59.34 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  61.8 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 91 aa  110  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  56.04 
 
 		 91 aa  110  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 95 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  110  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2802  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000141643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2488  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000405619  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  58.89 
 
 		 92 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0219  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.132966  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0964  histone family protein DNA-binding protein  57.61 
 
 		 92 aa  107  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000994236  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0991  DNA-binding protein HU  56.04 
 
 		 98 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.0000336504  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1731  DNA-binding protein HU  56.04 
 
 		 98 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000000434632  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0901  DNA-binding protein HU  56.04 
 
 		 98 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.00000000000106292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  56.82 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  55.06 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  54.44 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  54.44 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1108  nucleoid protein Hbs  56.18 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0932961  normal  0.770831 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  53.33 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  51.72 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_007413  Ava_1767  nucleoid protein Hbs  57.3 
 
 		 94 aa  103  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  51.11 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4401  nucleoid protein HU alpha subunit  54.44 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.177499 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  50.57 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 94 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  52.22 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70600  HU family DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  48.89 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43920  histone-like DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 94 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  57.95 
 
 		 91 aa  102  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0045  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48480  histone-like DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.707299  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0532  histone-like protein  54.44 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0600  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0791658  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  53.33 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3249  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  54.55 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1225  DNA-binding protein HU  56.47 
 
 		 100 aa  100  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  5.973909999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0798  DNA-binding protein HU 1 (DNA-binding protein II) (HB)  57.3 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.000000000041032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  57.3 
 
 		 96 aa  100  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  51.11 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  51.11 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3051  transcriptional regulator HU subunit beta  51.11 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2800  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 91 aa  100  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.314241 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6125  putative DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5600  nucleoid protein HU alpha subunit  52.22 
 
 		 91 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  54.55 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>