More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3229 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  184  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  81.32 
 
 		 91 aa  146  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  75.56 
 
 		 90 aa  135  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1362  histone-like DNA-binding protein  73.33 
 
 		 90 aa  133  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0045  histone family protein DNA-binding protein  67.78 
 
 		 90 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  66.29 
 
 		 90 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  64.44 
 
 		 91 aa  120  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  66.29 
 
 		 90 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1105  DNA-binding protein HU  64.44 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  64.44 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0875  histone family protein DNA-binding protein  64.44 
 
 		 90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.757232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  62.22 
 
 		 90 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  65.17 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  65.17 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  65.17 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  65.17 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  65.17 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  65.17 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  65.17 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  65.17 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  65.17 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  65.17 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  65.17 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  61.11 
 
 		 90 aa  114  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  63.33 
 
 		 90 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1341  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_28  DNA-binding protein HU-alpha  60 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1250  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  59.55 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  60 
 
 		 90 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2014  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000105311  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  61.8 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  61.8 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  60.67 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  62.5 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1412  histone-like DNA-binding protein  61.8 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000277772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  61.8 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  57.78 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  60.23 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0920  histone family protein DNA-binding protein  62.79 
 
 		 87 aa  107  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.417728  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  60.44 
 
 		 91 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 91 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 91 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 95 aa  106  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  61.36 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  60.23 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3781  HU family DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0095051  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  58.89 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43920  histone-like DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0964  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 92 aa  104  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000994236  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  56.82 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  61.11 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  60.23 
 
 		 91 aa  104  5e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0914  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.196839  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1035  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00000557803  hitchhiker  0.00000000462139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0600  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0791658  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1674  histone-like DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.171237 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3051  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4266  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1956  nucleoid protein Hbs  55.56 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.582961  normal  0.45981 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1745  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.693876  hitchhiker  0.00044049 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0430  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719598  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  53.33 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2063  HU family DNA-binding protein  54.44 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.832344  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0022  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00102315  hitchhiker  0.000567997 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>