More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0293 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 94 aa  187  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  86.52 
 
 		 91 aa  157  6e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0238  histone family protein DNA-binding protein  84.44 
 
 		 91 aa  153  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0362  histone-like DNA-binding protein  83.15 
 
 		 91 aa  149  8.999999999999999e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  83.15 
 
 		 90 aa  149  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1957  histone-like DNA-binding protein  78.65 
 
 		 91 aa  144  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000024611  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2673  histone family protein DNA-binding protein  77.53 
 
 		 91 aa  141  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156087  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1317  histone family protein DNA-binding protein  67.42 
 
 		 91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  62.22 
 
 		 90 aa  116  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  62.92 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  62.22 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  62.64 
 
 		 91 aa  110  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1797  HU family DNA-binding protein  62.22 
 
 		 90 aa  110  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1630  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 90 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000159632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1607  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 90 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022491  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2747  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 90 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276504  normal  0.581764 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  60 
 
 		 90 aa  110  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1596  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 90 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000169185  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2492  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 90 aa  110  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000348442  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2560  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 90 aa  110  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000135506  normal  0.0536414 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1493  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 90 aa  110  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000388309  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2505  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791734  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1926  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 92 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000201993  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2658  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000180426  normal  0.730265 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  61.11 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  60.44 
 
 		 94 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3781  HU family DNA-binding protein  61.11 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0095051  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1090  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1544  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000007734  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0491  transcriptional regulator HU subunit beta  58.89 
 
 		 90 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0126716  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0493  transcriptional regulator HU subunit beta  58.89 
 
 		 90 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  58.89 
 
 		 90 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0510  transcriptional regulator HU subunit beta  58.89 
 
 		 90 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0554  transcriptional regulator HU subunit beta  58.89 
 
 		 90 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00736621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2593  histone family protein DNA-binding protein  59.34 
 
 		 91 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 91 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  59.55 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  59.34 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3110  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000105676  hitchhiker  0.00000299463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1745  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  105  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.693876  hitchhiker  0.00044049 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  58.43 
 
 		 92 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  58.43 
 
 		 92 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  59.55 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  57.78 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00392  HU, DNA-binding transcriptional regulator, beta subunit  57.78 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0121  DNA-binding protein HU  56.47 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022412 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  57.78 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  57.78 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  57.78 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  57.78 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  57.78 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  57.78 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  57.78 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 91 aa  104  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 94 aa  104  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2058  histone-like DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.954956  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0500  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4704  histone-like DNA-binding protein  57.78 
 
 		 93 aa  104  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2207  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 91 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2492  histone-like DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00401844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2678  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 91 aa  103  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2215  histone family protein DNA-binding protein  60.92 
 
 		 95 aa  103  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000076232  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0907  transcriptional regulator HU subunit beta  55.56 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 92 aa  103  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1412  histone-like DNA-binding protein  56.04 
 
 		 91 aa  103  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000277772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2014  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000105311  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1364  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1227  HU family DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000165625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1666  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0914  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.196839  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  59.55 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1035  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00000557803  hitchhiker  0.00000000462139 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0532  histone-like protein  54.95 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2799  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 91 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  54.44 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1633  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2621  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348082  normal  0.0833374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1187  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0170  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 94 aa  100  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000201093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0188  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 94 aa  100  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3065  nucleoid protein Hbs  54.44 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135138  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0022  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00102315  hitchhiker  0.000567997 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2463  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0228112  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0087  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2053  nucleoid protein HU beta subunit  56.67 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000457213  normal  0.0670315 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  54.44 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1098  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00970005  hitchhiker  0.00000236625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1430  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000153062  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4159  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 91 aa  99.4  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>