More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1900 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 90 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2058  histone-like DNA-binding protein  76.67 
 
 		 90 aa  142  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.954956  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0500  histone family protein DNA-binding protein  71.11 
 
 		 90 aa  137  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759527 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1364  histone family protein DNA-binding protein  72.22 
 
 		 90 aa  135  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1090  histone family protein DNA-binding protein  69.66 
 
 		 90 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2463  histone family protein DNA-binding protein  70 
 
 		 90 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0228112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  61.8 
 
 		 91 aa  110  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  61.8 
 
 		 96 aa  107  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 91 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1430  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  107  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000153062  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1957  histone-like DNA-binding protein  58.43 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000024611  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0083  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  56.18 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  59.55 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  59.55 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  58.89 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0219  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.132966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  57.3 
 
 		 91 aa  103  7e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 94 aa  103  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  55.06 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0238  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2207  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1926  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000201993  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  57.14 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1918  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000897645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2673  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156087  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 95 aa  100  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0087  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 92 aa  100  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  56.18 
 
 		 91 aa  100  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0121  DNA-binding protein HU  57.65 
 
 		 88 aa  100  9e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022412 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2799  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  56.18 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1546  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 92 aa  99.4  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.0402e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0362  histone-like DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0846  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000034735  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  55.06 
 
 		 91 aa  99.4  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 95 aa  98.6  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  97.8  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0188  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 94 aa  97.1  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0170  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 94 aa  97.1  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000201093 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1717  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000293556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 91 aa  97.1  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10570  histone family protein DNA-binding protein  52.58 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 91 aa  96.7  9e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 91 aa  96.7  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  52.81 
 
 		 91 aa  96.7  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1250  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1341  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  57.3 
 
 		 91 aa  95.9  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  50.56 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  53.33 
 
 		 92 aa  94.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0964  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000994236  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0907  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1866  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0187787  hitchhiker  0.00274705 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1533  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.753498  normal  0.353479 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  53.93 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  94.4  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2857  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000465869  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  52.87 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2665  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 91 aa  94  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00920373  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00392  HU, DNA-binding transcriptional regulator, beta subunit  52.81 
 
 		 90 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  52.81 
 
 		 90 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  52.81 
 
 		 90 aa  93.6  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  52.81 
 
 		 90 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  52.81 
 
 		 90 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  93.6  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  52.81 
 
 		 90 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  52.81 
 
 		 90 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1666  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  93.6  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  52.81 
 
 		 90 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>