More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_10570 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_10570  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 137 aa  271  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  60.82 
 
 		 90 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  60.82 
 
 		 90 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  60.82 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  60.82 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  60.82 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  60.82 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  60.82 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  60.82 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  60.82 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  60.82 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  60.82 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  60.82 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  60.82 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  60.82 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  58.16 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  57.58 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0083  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  57.73 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  57.58 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  54.55 
 
 		 91 aa  107  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  56.7 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  56.7 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  56.7 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  58.16 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  53.61 
 
 		 92 aa  104  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  53.54 
 
 		 91 aa  103  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0183  DNA-binding protein HU 1  52.58 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000296943  hitchhiker  2.26878e-36 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  54.55 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  55.79 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  56.7 
 
 		 95 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  54.64 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  55.1 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0184  DNA-binding protein HU 1  52.58 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  53.61 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  53.61 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  53.61 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  53.61 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  53.61 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  53.61 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  53.61 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  53.61 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  53.61 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  53.61 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  51.55 
 
 		 91 aa  98.6  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  51.55 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  52.58 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  52.58 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  51.55 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  55.1 
 
 		 91 aa  97.8  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  49.49 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  51.55 
 
 		 92 aa  97.4  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0219  histone family protein DNA-binding protein  53.06 
 
 		 96 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.132966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  48.42 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  52.58 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  47.37 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  50.52 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  49.49 
 
 		 91 aa  94.7  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  48.45 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  54.64 
 
 		 94 aa  94.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  54.64 
 
 		 94 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1341  histone family protein DNA-binding protein  52.58 
 
 		 91 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  49.48 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0956  histone family protein DNA-binding protein  51.55 
 
 		 98 aa  93.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0983  histone family protein DNA-binding protein  51.55 
 
 		 98 aa  93.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0475372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1250  histone family protein DNA-binding protein  52.04 
 
 		 91 aa  93.6  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0500  histone family protein DNA-binding protein  47.96 
 
 		 90 aa  93.6  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759527 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  49.48 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  44.9 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00213  DNA-binding protein  45.28 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  51.55 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1926  histone family protein DNA-binding protein  50.52 
 
 		 92 aa  92.8  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000201993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  48.45 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  49.49 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3051  transcriptional regulator HU subunit beta  48.45 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  48.45 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0045  histone family protein DNA-binding protein  50.52 
 
 		 90 aa  91.3  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165888  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00392  HU, DNA-binding transcriptional regulator, beta subunit  48.45 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  48.45 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  48.45 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  48.45 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  48.45 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  48.45 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0964  histone family protein DNA-binding protein  48 
 
 		 92 aa  90.9  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000994236  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  48.45 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  48.45 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  48.45 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0892  histone-like DNA-binding protein  51.02 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.879625  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  48.45 
 
 		 94 aa  90.5  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17471  histone-like DNA-binding protein  51.02 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.631409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1364  histone family protein DNA-binding protein  47.96 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2802  DNA-binding protein HU  48.45 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000141643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2488  DNA-binding protein HU  48.45 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000405619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  48.45 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  48.45 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  48.45 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  48.45 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  48.45 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  48.45 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>