More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2488 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2802  DNA-binding protein HU  100 
 
 		 91 aa  180  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000141643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2488  DNA-binding protein HU  100 
 
 		 91 aa  180  6e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000405619  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  72.53 
 
 		 91 aa  131  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  72.22 
 
 		 91 aa  126  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  70 
 
 		 91 aa  124  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  68.54 
 
 		 91 aa  122  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  68.89 
 
 		 91 aa  120  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  65.56 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  65.52 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0964  histone family protein DNA-binding protein  67.03 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000994236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  62.92 
 
 		 92 aa  114  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 95 aa  110  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  59.34 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  61.8 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  61.36 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  61.11 
 
 		 90 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0015  Histone-like DNA-binding protein  54.95 
 
 		 97 aa  103  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0430  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3158  histone-like DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  56.82 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1926  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 92 aa  102  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000201993  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  56.82 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  56.82 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  54.44 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  56.98 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3110  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000105676  hitchhiker  0.00000299463 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  57.3 
 
 		 92 aa  101  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  56.82 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0658  histone-like DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2492  histone-like DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00401844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2593  histone family protein DNA-binding protein  54.95 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1630  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000159632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1797  HU family DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2747  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276504  normal  0.581764 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1493  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000388309  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2492  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000348442  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2560  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000135506  normal  0.0536414 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1607  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022491  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1596  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000169185  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004041  DNA-binding protein HU-beta  53.33 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000015142  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2505  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791734  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  55.06 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2489  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 94 aa  99.4  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000311196  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0429  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 92 aa  99.8  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00929572  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2658  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000180426  normal  0.730265 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1509  DNA-binding protein HU-beta  53.33 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000490467  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1918  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 91 aa  98.6  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000897645  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2678  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0600  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  98.6  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0791658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1227  HU family DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000165625  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>