More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0964 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0964  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 92 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000994236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  66.3 
 
 		 91 aa  120  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  68.13 
 
 		 91 aa  120  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  63.04 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  66.3 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  67.03 
 
 		 91 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  64.84 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2802  DNA-binding protein HU  67.03 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000141643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2488  DNA-binding protein HU  67.03 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000405619  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  63.74 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  61.96 
 
 		 91 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  58.7 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  59.34 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  60.44 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  60.87 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  56.04 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  57.61 
 
 		 91 aa  107  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0083  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  58.89 
 
 		 90 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3398  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 92 aa  105  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000223697  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  57.14 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 90 aa  103  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  58.43 
 
 		 91 aa  103  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1596  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000169185  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1797  HU family DNA-binding protein  58.24 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1493  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000388309  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1607  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022491  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2492  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000348442  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2560  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000135506  normal  0.0536414 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2747  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276504  normal  0.581764 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1630  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000159632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  56.04 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  57.14 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  57.14 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  57.14 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  57.14 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2658  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000180426  normal  0.730265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3051  transcriptional regulator HU subunit beta  57.14 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488463  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0790  histone family protein DNA-binding protein  52.69 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000040725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  54.35 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2063  HU family DNA-binding protein  54.95 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.832344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1227  HU family DNA-binding protein  56.04 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000165625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004041  DNA-binding protein HU-beta  54.95 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000015142  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2846  DNA-binding protein HU-alpha  57.14 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  56.04 
 
 		 98 aa  101  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00213  DNA-binding protein  57.14 
 
 		 101 aa  101  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  55.56 
 
 		 92 aa  100  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  54.95 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3110  histone family protein DNA-binding protein  54.95 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000105676  hitchhiker  0.00000299463 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  56.82 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2678  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  55.06 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2492  histone-like DNA-binding protein  54.95 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00401844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>