More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0790 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0790  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 93 aa  184  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000040725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  60.44 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  60.44 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  60.44 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  61.54 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  61.96 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  62.92 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  60.44 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  60.44 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  60.44 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  60.44 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  60.44 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  60.44 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  60.44 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  60.44 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  60.44 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  60.44 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  60.44 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  60.44 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0964  histone family protein DNA-binding protein  52.69 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000994236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  58.7 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 95 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  59.14 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  55.43 
 
 		 91 aa  98.6  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  57.3 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  57.3 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  54.84 
 
 		 91 aa  98.2  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  56.52 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  55.43 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  56.04 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  56.04 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  56.04 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  56.04 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  56.04 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  56.04 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  56.04 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  56.04 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  56.52 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3051  transcriptional regulator HU subunit beta  56.52 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  56.52 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  56.04 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  56.52 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  54.35 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  56.52 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  54.35 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  48.39 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  55.43 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00392  HU, DNA-binding transcriptional regulator, beta subunit  56.52 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  56.52 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1227  HU family DNA-binding protein  55.43 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000165625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  56.52 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  56.52 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  56.52 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  56.52 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  56.52 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  56.52 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  55.43 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  56.52 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  53.76 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0491  transcriptional regulator HU subunit beta  57.61 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0126716  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0554  transcriptional regulator HU subunit beta  57.61 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00736621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  57.61 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  55.43 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0493  transcriptional regulator HU subunit beta  57.61 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0510  transcriptional regulator HU subunit beta  57.61 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  51.61 
 
 		 91 aa  94  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  53.26 
 
 		 91 aa  94  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  55.06 
 
 		 91 aa  94  7e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  49.46 
 
 		 91 aa  93.6  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1596  histone family protein DNA-binding protein  54.35 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000169185  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1797  HU family DNA-binding protein  54.35 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0907  transcriptional regulator HU subunit beta  55.43 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2747  histone family protein DNA-binding protein  54.35 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276504  normal  0.581764 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1630  histone family protein DNA-binding protein  54.35 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000159632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  55.43 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1493  histone family protein DNA-binding protein  54.35 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000388309  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2492  histone family protein DNA-binding protein  54.35 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000348442  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2560  histone family protein DNA-binding protein  54.35 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000135506  normal  0.0536414 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1607  histone family protein DNA-binding protein  54.35 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022491  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2658  histone family protein DNA-binding protein  54.35 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000180426  normal  0.730265 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  52.69 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  55.43 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  56.52 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  56.04 
 
 		 94 aa  92  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0219  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.132966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2678  histone family protein DNA-binding protein  53.26 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  56.04 
 
 		 94 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2492  histone-like DNA-binding protein  54.35 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00401844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  52.17 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  51.58 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  54.35 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 92 aa  91.3  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  53.93 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  52.17 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  56.04 
 
 		 96 aa  90.5  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2593  histone family protein DNA-binding protein  53.26 
 
 		 91 aa  90.9  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>