More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2665 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2665  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00920373  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2215  histone family protein DNA-binding protein  68.13 
 
 		 95 aa  120  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000076232  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1893  histone family protein DNA-binding protein  61.54 
 
 		 126 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.73585  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  63.22 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  60.92 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  60.92 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2639  histone family protein DNA-binding protein  68.18 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000564133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  55.68 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0658  histone-like DNA-binding protein  57.47 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  57.47 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2463  histone family protein DNA-binding protein  60.92 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0228112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  58.62 
 
 		 94 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  57.47 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  57.47 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1051  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000497636  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0548  HU family DNA-binding protein  55.17 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  54.55 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0547  histone family protein DNA-binding protein  55.17 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0188  histone family protein DNA-binding protein  57.47 
 
 		 94 aa  100  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  57.47 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0170  histone family protein DNA-binding protein  57.47 
 
 		 94 aa  100  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000201093 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  57.47 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0548  histone family protein DNA-binding protein  55.17 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  56.32 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0362  histone-like DNA-binding protein  56.32 
 
 		 91 aa  98.6  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0430  histone family protein DNA-binding protein  56.32 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3817  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3325  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3943  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3482  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3761  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.768478 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0507  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0267079  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  55.17 
 
 		 94 aa  97.4  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  56.32 
 
 		 92 aa  97.1  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2673  histone family protein DNA-binding protein  51.72 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156087  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  56.82 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004041  DNA-binding protein HU-beta  55.17 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000015142  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01420  nucleoid DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3158  histone-like DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  55.17 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  51.72 
 
 		 94 aa  94.4  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  51.72 
 
 		 94 aa  94.4  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3110  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000105676  hitchhiker  0.00000299463 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0500  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759527 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2658  histone family protein DNA-binding protein  55.17 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000180426  normal  0.730265 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2492  histone-like DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  94.4  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00401844  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1957  histone-like DNA-binding protein  54.02 
 
 		 91 aa  93.6  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000024611  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2593  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 91 aa  93.6  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2857  histone family protein DNA-binding protein  55.68 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000465869  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0022  DNA-binding protein HU  55.17 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00102315  hitchhiker  0.000567997 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2505  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791734  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0087  histone family protein DNA-binding protein  59.09 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1797  HU family DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2678  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1596  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000169185  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2747  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276504  normal  0.581764 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1607  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022491  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1630  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000159632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1926  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000201993  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2492  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000348442  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2560  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000135506  normal  0.0536414 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1493  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000388309  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1544  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  92  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000007734  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3781  HU family DNA-binding protein  55.17 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0095051  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3723  DNA-binding protein HU-beta  56.32 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1750  histone-like DNA-binding protein  56.32 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.519537  normal  0.0235988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3694  nucleoid protein HU beta subunit  56.32 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.566059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1509  DNA-binding protein HU-beta  52.87 
 
 		 90 aa  92  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000490467  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1430  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  91.7  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000153062  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  54.02 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 91 aa  91.3  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1364  histone family protein DNA-binding protein  50.57 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0238  histone family protein DNA-binding protein  53.49 
 
 		 91 aa  90.9  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2802  DNA-binding protein HU  51.72 
 
 		 91 aa  90.5  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000141643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2488  DNA-binding protein HU  51.72 
 
 		 91 aa  90.5  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000405619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1035  histone family protein DNA-binding protein  50.57 
 
 		 90 aa  90.1  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00000557803  hitchhiker  0.00000000462139 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0914  DNA-binding protein HU  50.57 
 
 		 90 aa  90.1  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.196839  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  50.57 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1743  histone family protein DNA-binding protein  51.72 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  51.72 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1912  histone family protein DNA-binding protein  52.27 
 
 		 88 aa  90.1  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  56.32 
 
 		 91 aa  88.6  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2058  histone-like DNA-binding protein  51.72 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.954956  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  51.72 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  50.57 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  51.72 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  54.55 
 
 		 91 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  52.87 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  52.87 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4704  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 93 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  51.72 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0554  transcriptional regulator HU subunit beta  51.72 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00736621  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>