More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2207 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2207  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  177  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2799  histone family protein DNA-binding protein  89.01 
 
 		 91 aa  161  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  81.32 
 
 		 91 aa  150  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0087  histone family protein DNA-binding protein  81.32 
 
 		 91 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0500  histone family protein DNA-binding protein  64.84 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759527 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  61.54 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2058  histone-like DNA-binding protein  61.54 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.954956  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1364  histone family protein DNA-binding protein  62.64 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 94 aa  104  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1090  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1957  histone-like DNA-binding protein  60 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000024611  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2463  histone family protein DNA-binding protein  59.34 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0228112  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 91 aa  101  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0362  histone-like DNA-binding protein  58.89 
 
 		 91 aa  98.6  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  57.78 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  54.95 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0238  histone family protein DNA-binding protein  54.95 
 
 		 91 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  56.67 
 
 		 91 aa  94.4  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1430  histone family protein DNA-binding protein  54.95 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000153062  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  55.56 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2014  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000105311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 94 aa  94  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 92 aa  93.6  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1035  histone family protein DNA-binding protein  54.95 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00000557803  hitchhiker  0.00000000462139 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0914  DNA-binding protein HU  54.95 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.196839  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2673  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156087  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0550  DNA-binding protein HU-beta  58.24 
 
 		 92 aa  92.8  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  54.95 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  55.56 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2356  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 90 aa  92  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1870  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130937 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  51.14 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1546  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.0402e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  52.75 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  53.85 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  56.67 
 
 		 96 aa  90.5  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  53.33 
 
 		 126 aa  90.1  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  53.33 
 
 		 92 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  53.33 
 
 		 92 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  53.33 
 
 		 92 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  53.33 
 
 		 92 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  53.33 
 
 		 92 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  53.33 
 
 		 92 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  50.55 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0721  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  50 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4159  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3268  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 93 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0188  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  52.22 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  52.22 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0170  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000201093 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2248  nucleoid protein Hbs  46.15 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0990789 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3538  HU family DNA-binding protein  50 
 
 		 92 aa  88.2  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00490432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 92 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3392  HU family DNA-binding protein  48.35 
 
 		 92 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000680811  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000311196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0493  transcriptional regulator HU subunit beta  52.75 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0554  transcriptional regulator HU subunit beta  52.75 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00736621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  50.55 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0510  transcriptional regulator HU subunit beta  52.75 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  52.75 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0491  transcriptional regulator HU subunit beta  52.75 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0126716  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1533  histone family protein DNA-binding protein  49.45 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.753498  normal  0.353479 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  49.45 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  54.44 
 
 		 91 aa  87  8e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0846  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 104 aa  87  8e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000034735  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 		 91 aa  86.7  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2054  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 91 aa  86.7  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333504  normal  0.0104655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2824  nucleoid protein Hbs  48.89 
 
 		 91 aa  86.7  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.669113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  50.55 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  50.55 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2650  DNA-binding protein HU  51.65 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2337  histone-like DNA-binding protein  53.85 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000498066  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  49.45 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  50 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 91 aa  86.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0430  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  50.55 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0907  transcriptional regulator HU subunit beta  51.65 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1873  HU family DNA-binding protein  53.85 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.972501  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0213  transcriptional regulator HU subunit alpha  49.45 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00855152  normal  0.0112419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>