More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1957 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1957  histone-like DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  179  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000024611  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  90 
 
 		 91 aa  159  9e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0362  histone-like DNA-binding protein  80.22 
 
 		 91 aa  149  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  80.9 
 
 		 90 aa  147  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0238  histone family protein DNA-binding protein  83.52 
 
 		 91 aa  147  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2673  histone family protein DNA-binding protein  82.42 
 
 		 91 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156087  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  78.65 
 
 		 94 aa  144  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1317  histone family protein DNA-binding protein  68.89 
 
 		 91 aa  124  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 92 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1926  histone family protein DNA-binding protein  61.54 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000201993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  65.17 
 
 		 94 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  59.55 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  62.64 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0500  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759527 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  61.8 
 
 		 90 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  61.54 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  61.11 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  61.8 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0493  transcriptional regulator HU subunit beta  64.04 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0510  transcriptional regulator HU subunit beta  64.04 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0491  transcriptional regulator HU subunit beta  64.04 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0126716  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0554  transcriptional regulator HU subunit beta  64.04 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00736621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  64.04 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  107  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  61.54 
 
 		 94 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  60.67 
 
 		 90 aa  107  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00392  HU, DNA-binding transcriptional regulator, beta subunit  62.92 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  62.92 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  62.92 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  62.92 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  62.92 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  62.92 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  62.92 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  62.92 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  62.92 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1090  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  60.67 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  60.67 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  60.67 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3051  transcriptional regulator HU subunit beta  60.67 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  60.67 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  61.8 
 
 		 94 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0907  transcriptional regulator HU subunit beta  60.67 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  60.67 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0170  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 94 aa  103  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000201093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0188  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 94 aa  103  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1364  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0121  DNA-binding protein HU  53.49 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022412 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 94 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2058  histone-like DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.954956  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 94 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3781  HU family DNA-binding protein  59.77 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0095051  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2207  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  58.43 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0430  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1905  histone family protein DNA-binding protein  61.8 
 
 		 90 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173408  hitchhiker  0.000216257 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 91 aa  101  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2799  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 91 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1098  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 101 aa  100  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00970005  hitchhiker  0.00000236625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3158  histone-like DNA-binding protein  55.06 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0658  histone-like DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2053  nucleoid protein HU beta subunit  59.55 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000457213  normal  0.0670315 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1227  HU family DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000165625  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1873  HU family DNA-binding protein  59.55 
 
 		 91 aa  100  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.972501  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0507  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0267079  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2063  HU family DNA-binding protein  57.14 
 
 		 91 aa  100  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.832344  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3943  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3761  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.768478 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3817  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1745  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.693876  hitchhiker  0.00044049 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3325  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2303  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0561689  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2857  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000465869  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2215  histone family protein DNA-binding protein  62.07 
 
 		 95 aa  100  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000076232  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3466  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360259  hitchhiker  0.000212777 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000311196  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1797  HU family DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1630  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000159632  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  56.18 
 
 		 92 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  56.18 
 
 		 92 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2505  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791734  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1596  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000169185  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1493  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000388309  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  57.3 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23600  histone-like DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2492  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000348442  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2747  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276504  normal  0.581764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2658  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000180426  normal  0.730265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>