More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2215 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2215  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 95 aa  181  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000076232  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1893  histone family protein DNA-binding protein  72.53 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.73585  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2639  histone family protein DNA-binding protein  77.89 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000564133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2665  histone family protein DNA-binding protein  68.13 
 
 		 91 aa  120  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00920373  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  61.7 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  61.7 
 
 		 94 aa  107  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  63.16 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  61.36 
 
 		 91 aa  107  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0658  histone-like DNA-binding protein  62.07 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  61.7 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0548  HU family DNA-binding protein  58.62 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  60.23 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  62.07 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  62.07 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0547  histone family protein DNA-binding protein  57.47 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0188  histone family protein DNA-binding protein  57.45 
 
 		 94 aa  103  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0170  histone family protein DNA-binding protein  57.45 
 
 		 94 aa  103  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000201093 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  60.92 
 
 		 94 aa  103  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0548  histone family protein DNA-binding protein  57.47 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3325  histone family protein DNA-binding protein  57.47 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1926  histone family protein DNA-binding protein  60.92 
 
 		 92 aa  103  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000201993  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3761  histone family protein DNA-binding protein  57.47 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.768478 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3943  histone family protein DNA-binding protein  57.47 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3817  histone family protein DNA-binding protein  57.47 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0507  histone family protein DNA-binding protein  57.47 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0267079  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  60.92 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  60.92 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  62.07 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3482  histone family protein DNA-binding protein  56.32 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  60.92 
 
 		 90 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3158  histone-like DNA-binding protein  58.62 
 
 		 90 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2492  histone-like DNA-binding protein  62.07 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00401844  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0362  histone-like DNA-binding protein  60.92 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  59.77 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  59.77 
 
 		 92 aa  100  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2673  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156087  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2593  histone family protein DNA-binding protein  60.92 
 
 		 91 aa  100  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1957  histone-like DNA-binding protein  62.07 
 
 		 91 aa  100  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000024611  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2505  histone family protein DNA-binding protein  59.77 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791734  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2463  histone family protein DNA-binding protein  59.77 
 
 		 90 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0228112  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1544  histone family protein DNA-binding protein  59.77 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000007734  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1797  HU family DNA-binding protein  59.77 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1630  histone family protein DNA-binding protein  59.77 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000159632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2747  histone family protein DNA-binding protein  59.77 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276504  normal  0.581764 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  58.62 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1596  histone family protein DNA-binding protein  59.77 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000169185  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2492  histone family protein DNA-binding protein  59.77 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000348442  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2560  histone family protein DNA-binding protein  59.77 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000135506  normal  0.0536414 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1607  histone family protein DNA-binding protein  59.77 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022491  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2658  histone family protein DNA-binding protein  59.77 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000180426  normal  0.730265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1493  histone family protein DNA-binding protein  59.77 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000388309  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0430  histone family protein DNA-binding protein  57.47 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2678  histone family protein DNA-binding protein  59.77 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3110  histone family protein DNA-binding protein  58.62 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000105676  hitchhiker  0.00000299463 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01420  nucleoid DNA-binding protein  54.95 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004041  DNA-binding protein HU-beta  54.95 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000015142  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1430  histone family protein DNA-binding protein  56.32 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000153062  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  56.32 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  56.32 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  57.47 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5600  nucleoid protein HU alpha subunit  56.32 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  57.47 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4401  nucleoid protein HU alpha subunit  56.32 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.177499 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4704  histone-like DNA-binding protein  50.54 
 
 		 93 aa  95.5  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1509  DNA-binding protein HU-beta  54.95 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000490467  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3781  HU family DNA-binding protein  57.14 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0095051  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  55.17 
 
 		 91 aa  94.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2857  histone family protein DNA-binding protein  61.36 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000465869  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70600  HU family DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09623  probable DNA-binding protein HU  54.65 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.355669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1918  histone family protein DNA-binding protein  54.55 
 
 		 91 aa  93.6  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000897645  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3493  DNA-binding protein HU  59.77 
 
 		 90 aa  93.2  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.175993  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 		 91 aa  93.6  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41210  DNA-binding protein HU  59.77 
 
 		 90 aa  93.2  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0758892  normal  0.416187 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00392  HU, DNA-binding transcriptional regulator, beta subunit  57.47 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  57.47 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  57.47 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  56.82 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  57.47 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0510  transcriptional regulator HU subunit beta  57.47 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  57.47 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0491  transcriptional regulator HU subunit beta  57.47 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0126716  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  57.47 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0238  histone family protein DNA-binding protein  56.98 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  56.32 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  57.47 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1098  histone family protein DNA-binding protein  56.32 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00970005  hitchhiker  0.00000236625 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0493  transcriptional regulator HU subunit beta  57.47 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  57.47 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  57.47 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  57.47 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0554  transcriptional regulator HU subunit beta  57.47 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00736621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0045  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1717  histone family protein DNA-binding protein  60.23 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000293556  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1227  HU family DNA-binding protein  57.47 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000165625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0907  transcriptional regulator HU subunit beta  57.47 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0222  transcriptional regulator HU subunit alpha  55.17 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1035  histone family protein DNA-binding protein  55.17 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00000557803  hitchhiker  0.00000000462139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>