More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0324 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 90 aa  175  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  87.64 
 
 		 91 aa  157  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  83.15 
 
 		 94 aa  149  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0362  histone-like DNA-binding protein  82.02 
 
 		 91 aa  148  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1957  histone-like DNA-binding protein  80.9 
 
 		 91 aa  147  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000024611  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0238  histone family protein DNA-binding protein  83.72 
 
 		 91 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2673  histone family protein DNA-binding protein  75.56 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156087  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  61.8 
 
 		 90 aa  114  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1317  histone family protein DNA-binding protein  62.92 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  62.92 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  63.22 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  59.55 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1596  histone family protein DNA-binding protein  64.04 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000169185  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1797  HU family DNA-binding protein  64.04 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2747  histone family protein DNA-binding protein  64.04 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276504  normal  0.581764 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1493  histone family protein DNA-binding protein  64.04 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000388309  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2492  histone family protein DNA-binding protein  64.04 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000348442  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2560  histone family protein DNA-binding protein  64.04 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000135506  normal  0.0536414 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1607  histone family protein DNA-binding protein  64.04 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022491  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1630  histone family protein DNA-binding protein  64.04 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000159632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1926  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 92 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000201993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  62.92 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2658  histone family protein DNA-binding protein  62.92 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000180426  normal  0.730265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 90 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  59.77 
 
 		 90 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  60.67 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1745  histone family protein DNA-binding protein  61.8 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.693876  hitchhiker  0.00044049 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  59.55 
 
 		 92 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  59.55 
 
 		 92 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0554  transcriptional regulator HU subunit beta  60.67 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00736621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0491  transcriptional regulator HU subunit beta  60.67 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0126716  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0510  transcriptional regulator HU subunit beta  60.67 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0493  transcriptional regulator HU subunit beta  60.67 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  60.67 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2505  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791734  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0914  DNA-binding protein HU  60.67 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.196839  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2678  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2053  nucleoid protein HU beta subunit  60.67 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000457213  normal  0.0670315 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1035  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00000557803  hitchhiker  0.00000000462139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2593  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1544  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000007734  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00392  HU, DNA-binding transcriptional regulator, beta subunit  59.55 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  59.55 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  59.55 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  59.55 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3110  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000105676  hitchhiker  0.00000299463 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  59.55 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  60 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  59.55 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  59.55 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  59.55 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  58.43 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0658  histone-like DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2492  histone-like DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00401844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  58.89 
 
 		 94 aa  103  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  58.89 
 
 		 94 aa  103  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  57.78 
 
 		 91 aa  103  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3493  DNA-binding protein HU  59.55 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.175993  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0907  transcriptional regulator HU subunit beta  58.43 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41210  DNA-binding protein HU  59.55 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0758892  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3158  histone-like DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 91 aa  103  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3781  HU family DNA-binding protein  59.77 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0095051  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2014  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000105311  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0188  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 94 aa  102  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  58.43 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  58.62 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0170  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 94 aa  102  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000201093 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  58.43 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1227  HU family DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000165625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23600  histone-like DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  56.18 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1509  DNA-binding protein HU-beta  58.62 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000490467  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0022  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00102315  hitchhiker  0.000567997 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09623  probable DNA-binding protein HU  55.06 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.355669  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0548  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  59.09 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0507  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0267079  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2215  histone family protein DNA-binding protein  60.92 
 
 		 95 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000076232  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3817  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3325  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  57.3 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3761  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.768478 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3943  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  57.3 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>