More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1051 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1051  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 89 aa  178  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000497636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  59.3 
 
 		 94 aa  103  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  59.3 
 
 		 94 aa  103  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2665  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00920373  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  56.98 
 
 		 96 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1546  histone family protein DNA-binding protein  53.49 
 
 		 92 aa  97.1  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.0402e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3327  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.372094  normal  0.0697763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  55.81 
 
 		 94 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1909  histone family protein DNA-binding protein  53.49 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2292  nucleoid protein Hbs  52.33 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1014  histone family protein DNA-binding protein  52.33 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0170  histone family protein DNA-binding protein  53.49 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000201093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0188  histone family protein DNA-binding protein  53.49 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0920  histone family protein DNA-binding protein  52.44 
 
 		 87 aa  92  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.417728  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2463  histone family protein DNA-binding protein  51.16 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0228112  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0500  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759527 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  51.16 
 
 		 95 aa  88.6  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  48.84 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  48.84 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  48.84 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1364  histone family protein DNA-binding protein  48.84 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  48.24 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  51.76 
 
 		 91 aa  88.2  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  47.67 
 
 		 90 aa  87.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  49.43 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0219  histone family protein DNA-binding protein  46.51 
 
 		 96 aa  87  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.132966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  46.51 
 
 		 91 aa  87.4  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1633  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  48.28 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  48.84 
 
 		 91 aa  86.7  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  45.45 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  45.35 
 
 		 90 aa  85.9  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2215  histone family protein DNA-binding protein  47.73 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000076232  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  46.51 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1957  histone-like DNA-binding protein  48.84 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000024611  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  46.51 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4704  histone-like DNA-binding protein  49.43 
 
 		 93 aa  86.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  46.51 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10570  histone family protein DNA-binding protein  47.37 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  46.51 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1341  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  46.51 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3051  transcriptional regulator HU subunit beta  46.51 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  51.16 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  46.51 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  48.84 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  47.67 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  51.16 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  49.41 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1250  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0022  DNA-binding protein HU  48.84 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00102315  hitchhiker  0.000567997 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  42.53 
 
 		 90 aa  84.7  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  46.51 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2058  histone-like DNA-binding protein  47.67 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.954956  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  47.67 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  42.53 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  44.19 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  50 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  47.67 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1956  nucleoid protein Hbs  47.67 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.582961  normal  0.45981 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1090  histone family protein DNA-binding protein  47.67 
 
 		 90 aa  84.3  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  47.67 
 
 		 92 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2650  DNA-binding protein HU  45.35 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  45.35 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0548  histone family protein DNA-binding protein  46.51 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  45.35 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  45.98 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0238  histone family protein DNA-binding protein  47.67 
 
 		 91 aa  84  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1098  histone family protein DNA-binding protein  45.35 
 
 		 101 aa  84  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00970005  hitchhiker  0.00000236625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3065  nucleoid protein Hbs  47.67 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135138  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4401  nucleoid protein HU alpha subunit  45.35 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.177499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  44.32 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  47.67 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1105  DNA-binding protein HU  46.51 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  43.02 
 
 		 90 aa  83.6  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2673  histone family protein DNA-binding protein  45.35 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156087  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  47.67 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  44.32 
 
 		 91 aa  83.6  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  45.35 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  45.35 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  45.35 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  45.35 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  44.19 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0547  histone family protein DNA-binding protein  45.35 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>