More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1217 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1217  histone-like DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  177  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.778852  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2632  histone-like DNA-binding protein  84.62 
 
 		 91 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5141  histone family protein DNA-binding protein  78.89 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.467193 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0009  histone-like DNA-binding protein  70.11 
 
 		 130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2320  histone family protein DNA-binding protein  61.54 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313993 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9178  HNS-type DNA binding protein  60 
 
 		 92 aa  107  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.654708  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2219  histone family protein DNA-binding protein  59.78 
 
 		 92 aa  106  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.789532  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7042  HNS-type DNA binding protein  62.79 
 
 		 92 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.815664  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1806  histone family protein DNA-binding protein  57.61 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5182  histone family protein DNA-binding protein  57.61 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.022675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4234  histone-like DNA-binding protein  66.67 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.482395  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8123  HNS-type DNA binding protein  58.43 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.029087  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8027  HNS-type DNA binding protein  56.18 
 
 		 92 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6198  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 92 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0309609  normal  0.013935 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5718  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 92 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0779514  normal  0.621503 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4761  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 92 aa  99.4  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00588654  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0576  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  50.57 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1870  histone family protein DNA-binding protein  52.33 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130937 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3781  HU family DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0095051  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1118  HU family DNA-binding protein  53.33 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  49.43 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  52.33 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  51.16 
 
 		 91 aa  84.3  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  50.57 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  50.57 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  50.57 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  50.57 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  50.57 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  50.57 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  50.57 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  50.57 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  50.57 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  50.57 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  50.57 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2903  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00933352  normal  0.626047 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  83.6  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  50.57 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  83.6  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1251  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0902596  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4159  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 91 aa  83.6  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2824  nucleoid protein Hbs  47.25 
 
 		 91 aa  83.6  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.669113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  47.13 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  47.13 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2054  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 91 aa  83.6  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333504  normal  0.0104655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1412  histone-like DNA-binding protein  52.81 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000277772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  46.07 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  49.43 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  49.45 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  49.43 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  49.43 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  49.43 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_28  DNA-binding protein HU-alpha  51.11 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1538  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000676058  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1362  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3110  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000105676  hitchhiker  0.00000299463 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00392  HU, DNA-binding transcriptional regulator, beta subunit  47.78 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  48.89 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3723  DNA-binding protein HU-beta  47.78 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl201  histone-like DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.25153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1750  histone-like DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.519537  normal  0.0235988 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09623  probable DNA-binding protein HU  46.67 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.355669  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3694  nucleoid protein HU beta subunit  47.78 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.566059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  47.78 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  48.35 
 
 		 91 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  47.78 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  48.89 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00213  DNA-binding protein  46.67 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  47.78 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  47.78 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  47.78 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1544  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000007734  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  47.78 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  47.78 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0914  HU family DNA-binding protein  43.96 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03877  HU, DNA-binding transcriptional regulator, alpha subunit  47.13 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.380115  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4491  transcriptional regulator HU subunit alpha  47.13 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0852675  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1714  DNA-binding protein HU-beta  47.78 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.606946  normal  0.0324854 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1098  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00970005  hitchhiker  0.00000236625 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03830  hypothetical protein  47.13 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.485291  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1105  DNA-binding protein HU  48.35 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0290  transcriptional regulator HU subunit alpha  48.28 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0031706  hitchhiker  0.00995537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4448  transcriptional regulator HU subunit alpha  47.13 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.302586  hitchhiker  0.00101008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4266  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 93 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4543  transcriptional regulator HU subunit alpha  47.13 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.440082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0222  transcriptional regulator HU subunit alpha  48.28 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  51.16 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4025  transcriptional regulator HU subunit alpha  47.13 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0158227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>