More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0914 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0914  HU family DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  179  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1118  HU family DNA-binding protein  61.11 
 
 		 91 aa  117  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1251  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 91 aa  114  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0902596  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2903  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 91 aa  114  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00933352  normal  0.626047 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2054  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333504  normal  0.0104655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2824  nucleoid protein Hbs  52.75 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.669113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2014  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000105311  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  50 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 94 aa  94.7  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4266  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 93 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  48.89 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  47.78 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0184  DNA-binding protein HU 1  50.56 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1926  histone family protein DNA-binding protein  49.45 
 
 		 92 aa  91.3  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000201993  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3359  histone-like DNA-binding protein HU-beta (NS1)  55.26 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  50 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0183  DNA-binding protein HU 1  48.31 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000296943  hitchhiker  2.26878e-36 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0362  histone-like DNA-binding protein  45.05 
 
 		 91 aa  90.1  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  90.1  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0238  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 91 aa  90.1  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2621  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348082  normal  0.0833374 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 91 aa  90.1  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1187  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 91 aa  90.1  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2697  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_28  DNA-binding protein HU-alpha  50 
 
 		 91 aa  88.6  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1674  histone-like DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.171237 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  50 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  50.56 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1412  histone-like DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000277772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3231  histone family protein DNA-binding protein  53.95 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3555  histone family protein DNA-binding protein  53.95 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  52.33 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2673  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 95 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 92 aa  87.8  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  87.8  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0493  transcriptional regulator HU subunit beta  47.78 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0554  transcriptional regulator HU subunit beta  47.78 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00736621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0491  transcriptional regulator HU subunit beta  47.78 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0126716  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  48.15 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  47.78 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 95 aa  87.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0510  transcriptional regulator HU subunit beta  47.78 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00392  HU, DNA-binding transcriptional regulator, beta subunit  47.78 
 
 		 90 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1918  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 91 aa  87  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000897645  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  47.78 
 
 		 90 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  47.78 
 
 		 90 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23600  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  47.78 
 
 		 90 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  47.78 
 
 		 90 aa  87.4  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  47.78 
 
 		 90 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  47.78 
 
 		 90 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  47.78 
 
 		 90 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1362  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  48.89 
 
 		 90 aa  87  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 91 aa  86.7  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1666  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1493  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000388309  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2747  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276504  normal  0.581764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1797  HU family DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  50 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1607  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022491  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2492  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000348442  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2560  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000135506  normal  0.0536414 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1596  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000169185  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1630  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000159632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>