More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1870 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1870  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 
91 aa  182  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0130937 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  61.8 
 
 
91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 
90 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  60 
 
 
90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 
90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  60 
 
 
90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  60 
 
 
90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  60 
 
 
90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  60 
 
 
90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  60 
 
 
90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  60 
 
 
90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  60 
 
 
90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 
90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  60 
 
 
90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 
90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 
90 aa  103  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 
94 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  57.14 
 
 
91 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0532  histone-like protein  57.14 
 
 
94 aa  100  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 
90 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 
94 aa  99  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  54.95 
 
 
91 aa  98.6  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0087  histone family protein DNA-binding protein  54.95 
 
 
91 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  53.93 
 
 
94 aa  99.4  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  55.06 
 
 
91 aa  99  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  53.93 
 
 
96 aa  98.2  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  53.93 
 
 
90 aa  98.6  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 
90 aa  98.6  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  52.81 
 
 
98 aa  97.8  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4704  histone-like DNA-binding protein  51.69 
 
 
93 aa  97.1  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  52.33 
 
 
90 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1225  DNA-binding protein HU  52.94 
 
 
100 aa  96.3  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  5.973909999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 
91 aa  96.3  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  51.11 
 
 
90 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 
90 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 
90 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  51.69 
 
 
90 aa  95.5  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00392  HU, DNA-binding transcriptional regulator, beta subunit  50.56 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  50.56 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  50.56 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  55.06 
 
 
91 aa  95.1  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  53.93 
 
 
91 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  50.56 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  50.56 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  51.16 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  50.56 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  50.56 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  50.56 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  55.06 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0991  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
98 aa  94.4  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.0000336504  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0022  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 
90 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00102315  hitchhiker  0.000567997 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0901  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
98 aa  94.4  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.00000000000106292  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1731  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
98 aa  94.4  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000000434632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 
90 aa  94.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 
90 aa  94.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  54.55 
 
 
91 aa  94  6e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  51.69 
 
 
91 aa  94.4  6e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 
90 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 
90 aa  94  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 
90 aa  94  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 
91 aa  94  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  50.56 
 
 
90 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  50.56 
 
 
90 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0875  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 
90 aa  93.6  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.757232  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1341  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 
91 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3051  transcriptional regulator HU subunit beta  50.56 
 
 
90 aa  93.6  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488463  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0180  histone family protein DNA-binding protein  54.65 
 
 
100 aa  93.6  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000456063  normal  0.670354 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 
90 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 
90 aa  93.6  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 
90 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 
90 aa  93.6  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 
90 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 
90 aa  93.6  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 
90 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  49.44 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
NC_004310  BR1105  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 
91 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  50 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0554  transcriptional regulator HU subunit beta  49.44 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00736621  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0510  transcriptional regulator HU subunit beta  49.44 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0493  transcriptional regulator HU subunit beta  49.44 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1250  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 
91 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 
95 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 
95 aa  93.2  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1745  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.693876  hitchhiker  0.00044049 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0491  transcriptional regulator HU subunit beta  49.44 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0126716  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  48.31 
 
 
90 aa  92.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 
90 aa  92  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  50.56 
 
 
90 aa  92  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 
91 aa  92  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2337  histone-like DNA-binding protein  49.44 
 
 
90 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000498066  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  53.93 
 
 
91 aa  92.4  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 
92 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1098  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 
101 aa  92  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00970005  hitchhiker  0.00000236625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0914  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 
90 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.196839  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  48.89 
 
 
92 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  48.89 
 
 
92 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>