More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl201 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl201  histone-like DNA-binding protein  100 
 
 
90 aa  173  6e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.25153  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0575  DNA-binding protein HU 1  68.54 
 
 
90 aa  104  4e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0129135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  45.56 
 
 
90 aa  87.4  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 
91 aa  86.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_66  DNA-binding protein HU-alpha  46.67 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0113448  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0022  DNA-binding protein HU  46.67 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00102315  hitchhiker  0.000567997 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  47.19 
 
 
92 aa  84.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 
94 aa  84.3  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1870  histone family protein DNA-binding protein  45.35 
 
 
91 aa  84  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0130937 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43920  histone-like DNA-binding protein  46.67 
 
 
90 aa  84  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0313  DNA-binding protein, HU  48.31 
 
 
92 aa  84  7e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.657113  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0907  transcriptional regulator HU subunit beta  45.56 
 
 
90 aa  83.6  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_28  DNA-binding protein HU-alpha  47.78 
 
 
91 aa  83.2  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 
90 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 
90 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  45.98 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  43.33 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  43.33 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  42.53 
 
 
91 aa  81.3  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0576  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 
90 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  43.33 
 
 
90 aa  80.9  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  43.33 
 
 
90 aa  80.9  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  44.44 
 
 
90 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  45.98 
 
 
90 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1957  histone-like DNA-binding protein  40 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000024611  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  44.44 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00392  HU, DNA-binding transcriptional regulator, beta subunit  43.33 
 
 
90 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 
90 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  43.33 
 
 
90 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 
90 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0579  histone-like DNA-binding protein  41.11 
 
 
91 aa  80.1  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410031  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2092  nucleoid protein Hbs  41.11 
 
 
91 aa  80.1  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1108  nucleoid protein Hbs  41.11 
 
 
91 aa  80.1  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0932961  normal  0.770831 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  43.33 
 
 
90 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  43.33 
 
 
90 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  43.33 
 
 
90 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  43.33 
 
 
90 aa  80.1  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  43.33 
 
 
90 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  43.33 
 
 
90 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1666  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 
90 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2248  nucleoid protein Hbs  40 
 
 
91 aa  79.3  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0990789 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 
91 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4105  nucleoid protein Hbs  38.89 
 
 
110 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340401  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0510  transcriptional regulator HU subunit beta  43.33 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0491  transcriptional regulator HU subunit beta  43.33 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0126716  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  45.98 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  45.98 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0238  histone family protein DNA-binding protein  41.86 
 
 
91 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1918  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 
91 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000897645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  45.98 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  45.98 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  45.98 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  45.98 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  41.11 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  45.98 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1880  nucleoid DNA-binding protein  46.15 
 
 
94 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  45.56 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  45.98 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0554  transcriptional regulator HU subunit beta  43.33 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00736621  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  43.68 
 
 
91 aa  78.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  43.33 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  43.33 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1926  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 
92 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000201993  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0493  transcriptional regulator HU subunit beta  43.33 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0500  histone family protein DNA-binding protein  41.38 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759527 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  45.98 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  46.67 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 
91 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2320  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 
91 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0313993 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  44.19 
 
 
95 aa  78.2  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  42.22 
 
 
90 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2063  HU family DNA-binding protein  42.22 
 
 
91 aa  77.8  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.832344  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  45.98 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  43.18 
 
 
91 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  44.83 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  41.38 
 
 
90 aa  78.2  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000311196  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17471  histone-like DNA-binding protein  40 
 
 
91 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.631409  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01420  nucleoid DNA-binding protein  42.22 
 
 
90 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  42.22 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>