More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2248 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2248  nucleoid protein Hbs  100 
 
 		 91 aa  178  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0990789 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0579  histone-like DNA-binding protein  71.43 
 
 		 91 aa  138  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410031  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2092  nucleoid protein Hbs  71.43 
 
 		 91 aa  138  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0892  histone-like DNA-binding protein  71.43 
 
 		 91 aa  137  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.879625  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17471  histone-like DNA-binding protein  71.43 
 
 		 91 aa  137  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.631409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13741  histone-like DNA-binding protein  72.53 
 
 		 92 aa  135  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05711  histone-like DNA-binding protein  70.33 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1419  histone-like DNA-binding protein  69.23 
 
 		 91 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14821  histone-like DNA-binding protein  69.23 
 
 		 91 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15071  histone-like DNA-binding protein  68.13 
 
 		 91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15201  histone-like DNA-binding protein  68.13 
 
 		 91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.581406  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0721  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1108  nucleoid protein Hbs  56.67 
 
 		 91 aa  107  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0932961  normal  0.770831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1767  nucleoid protein Hbs  52.81 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1610  nucleoid protein Hbs  52.81 
 
 		 95 aa  103  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148246  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2489  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0956  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 98 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2937  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3159  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.124819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0983  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 98 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0475372 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  99.4  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0015  Histone-like DNA-binding protein  51.69 
 
 		 97 aa  97.8  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  52.81 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  50 
 
 		 90 aa  97.1  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  53.93 
 
 		 91 aa  94.4  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 91 aa  93.6  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0576  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  49.43 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1797  HU family DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2747  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276504  normal  0.581764 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1493  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000388309  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1607  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022491  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  51.11 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1596  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000169185  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_008321  Shewmr4_2492  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000348442  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2560  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000135506  normal  0.0536414 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0083  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  51.72 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1630  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000159632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  51.11 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  51.11 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  51.11 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  51.11 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  51.11 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  51.11 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  51.11 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 92 aa  91.7  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 92 aa  91.7  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  43.33 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  51.11 
 
 		 92 aa  91.7  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  51.11 
 
 		 92 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 92 aa  91.7  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  51.69 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 92 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2658  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000180426  normal  0.730265 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 92 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7326  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 92 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 92 aa  91.3  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  51.16 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  51.11 
 
 		 92 aa  91.3  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  91.3  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 92 aa  90.5  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  46.67 
 
 		 91 aa  90.9  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  50.56 
 
 		 91 aa  90.1  8e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1227  HU family DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000165625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  48.28 
 
 		 98 aa  90.1  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  46.67 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1544  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000007734  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3051  transcriptional regulator HU subunit beta  46.67 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  48.35 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  46.67 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0184  DNA-binding protein HU 1  52.22 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0532  histone-like protein  47.78 
 
 		 94 aa  89.4  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2505  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791734  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3110  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000105676  hitchhiker  0.00000299463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>