More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2632 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2632  histone-like DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  178  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1217  histone-like DNA-binding protein  84.62 
 
 		 91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.778852  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5141  histone family protein DNA-binding protein  80 
 
 		 92 aa  127  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.467193 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0009  histone-like DNA-binding protein  68.97 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2320  histone family protein DNA-binding protein  60.44 
 
 		 91 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313993 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7042  HNS-type DNA binding protein  61.8 
 
 		 92 aa  110  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.815664  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1806  histone family protein DNA-binding protein  58.7 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8123  HNS-type DNA binding protein  61.8 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.029087  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5182  histone family protein DNA-binding protein  60.87 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.022675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2219  histone family protein DNA-binding protein  59.78 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.789532  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9178  HNS-type DNA binding protein  56.67 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.654708  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8027  HNS-type DNA binding protein  52.22 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6198  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 92 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0309609  normal  0.013935 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4761  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00588654  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5718  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0779514  normal  0.621503 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4234  histone-like DNA-binding protein  59.77 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.482395  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  51.72 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  53.49 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  51.72 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  51.72 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  51.72 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  51.72 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  51.72 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  51.72 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  51.72 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  51.72 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  51.72 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  51.72 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  51.72 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  50.57 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0576  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4159  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  54.44 
 
 		 91 aa  88.2  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1870  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  87.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130937 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  87  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  48.28 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  85.5  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  41.76 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  41.76 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  41.76 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  46.74 
 
 		 92 aa  84  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2824  nucleoid protein Hbs  45.05 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.669113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  48.84 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2054  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333504  normal  0.0104655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2903  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00933352  normal  0.626047 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2356  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1251  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0902596  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  48.89 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  83.6  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  46.67 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3781  HU family DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0095051  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3723  DNA-binding protein HU-beta  47.78 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1750  histone-like DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.519537  normal  0.0235988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  51.72 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3694  nucleoid protein HU beta subunit  47.78 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.566059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  47.73 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  48.28 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  40 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2120  integration host factor, alpha subunit  40 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1118  HU family DNA-binding protein  47.78 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128568  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  46.15 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  48.84 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  45.56 
 
 		 90 aa  80.1  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3742  integration host factor, alpha subunit  43.48 
 
 		 100 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  0.554438 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1584  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 91 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.532726  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  47.13 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  48.84 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  44.83 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  44.44 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7326  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2302  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  47.13 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  46.15 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_003295  RSc1714  DNA-binding protein HU-beta  45.56 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.606946  normal  0.0324854 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0532  histone-like protein  44.83 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4704  histone-like DNA-binding protein  43.33 
 
 		 93 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1538  DNA-binding protein HU  45.56 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000676058  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4266  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 93 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  41.38 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  41.38 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1362  histone-like DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0045  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165888  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl201  histone-like DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.25153  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  44.44 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  44.44 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1090  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  44.44 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  44.44 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>