More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3758 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3758  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 90 aa  178  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.639339  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3249  histone-like DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48480  histone-like DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.707299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70600  HU family DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6125  putative DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5600  nucleoid protein HU alpha subunit  57.3 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4401  nucleoid protein HU alpha subunit  57.3 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.177499 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5472  DNA-binding protein HU family  55.06 
 
 		 111 aa  103  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5313  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 99 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0463079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5222  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 99 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5027  histone-like DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.705107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5361  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322215 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0083  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  55.06 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0160  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 99 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.982339  normal  0.332624 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  53.41 
 
 		 91 aa  96.7  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  53.93 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  53.41 
 
 		 91 aa  94.7  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  55.06 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  54.55 
 
 		 91 aa  94  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2063  HU family DNA-binding protein  51.69 
 
 		 91 aa  93.6  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.832344  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0914  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.196839  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1035  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00000557803  hitchhiker  0.00000000462139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  93.6  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 91 aa  93.6  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  48.31 
 
 		 90 aa  93.2  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0600  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0791658  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1251  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0902596  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0576  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2903  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00933352  normal  0.626047 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  51.14 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4266  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 93 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7326  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 94 aa  92  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 94 aa  92  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1430  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000153062  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  92  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43920  histone-like DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  50.56 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1745  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.693876  hitchhiker  0.00044049 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  50.56 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0184  DNA-binding protein HU 1  50 
 
 		 90 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 95 aa  90.9  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  49.44 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1957  histone-like DNA-binding protein  52.81 
 
 		 91 aa  90.9  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000024611  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  49.44 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  49.44 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  47.19 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0183  DNA-binding protein HU 1  50 
 
 		 90 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000296943  hitchhiker  2.26878e-36 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_28  DNA-binding protein HU-alpha  50.56 
 
 		 91 aa  90.1  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 92 aa  89.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01420  nucleoid DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  49.44 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  90.1  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  90.1  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  48.31 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2303  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0561689  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 92 aa  89.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0500  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759527 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1873  HU family DNA-binding protein  49.44 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.972501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  48.31 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0430  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  48.31 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  48.31 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  48.31 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  48.31 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1905  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173408  hitchhiker  0.000216257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3466  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360259  hitchhiker  0.000212777 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  48.31 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  47.78 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  47.78 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  47.78 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  47.78 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  52.27 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 92 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>