More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0835 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0835  integration host factor, alpha subunit  100 
 
 		 107 aa  219  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1004  integration host factor, alpha subunit  96.26 
 
 		 107 aa  213  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1281  integration host factor subunit alpha  73.4 
 
 		 138 aa  147  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1552  integration host factor, alpha subunit  72.16 
 
 		 117 aa  146  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1166  integration host factor subunit alpha  73.4 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.516424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1377  integration host factor subunit alpha  71.88 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377563  normal  0.528891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2750  integration host factor subunit alpha  71.88 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2589  integration host factor subunit alpha  69.31 
 
 		 134 aa  144  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1773  integration host factor subunit alpha  73.4 
 
 		 136 aa  144  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.330159 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1583  integration host factor subunit alpha  73.63 
 
 		 104 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4621  integration host factor subunit alpha  73.4 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0999  integration host factor subunit alpha  73.4 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1458  integration host factor subunit alpha  73.4 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1481  integration host factor subunit alpha  73.4 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1897  integration host factor subunit alpha  73.4 
 
 		 134 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1641  integration host factor subunit alpha  73.63 
 
 		 138 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.860546  normal  0.370826 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1741  integration host factor subunit alpha  73.4 
 
 		 134 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1718  integration host factor subunit alpha  73.4 
 
 		 134 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0197  integration host factor subunit alpha  71.88 
 
 		 134 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.878199  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1533  integration host factor subunit alpha  71.88 
 
 		 134 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.612274  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1090  integration host factor subunit alpha  71.88 
 
 		 134 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0969  integration host factor subunit alpha  71.88 
 
 		 134 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1405  integration host factor subunit alpha  73.91 
 
 		 131 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1365  integration host factor subunit alpha  73.91 
 
 		 131 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1971  integration host factor subunit alpha  73.63 
 
 		 138 aa  143  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2853  integration host factor subunit alpha  66.33 
 
 		 122 aa  140  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.769617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1997  integration host factor subunit alpha  72.53 
 
 		 100 aa  140  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000120885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2108  integration host factor subunit alpha  65.31 
 
 		 111 aa  137  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.283165  normal  0.12287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3019  integration host factor subunit alpha  71.43 
 
 		 101 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.616425  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2671  integration host factor subunit alpha  72.53 
 
 		 100 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.998853 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3095  integration host factor subunit alpha  62.38 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0706803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4610  integration host factor subunit alpha  61.86 
 
 		 110 aa  134  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428618  normal  0.0608017 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2394  integration host factor subunit alpha  61 
 
 		 116 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1454  integration host factor subunit alpha  61 
 
 		 116 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0493  integration host factor subunit alpha  62.63 
 
 		 101 aa  131  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1013  integration host factor subunit alpha  68.13 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00925023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1342  integration host factor, alpha subunit  63.04 
 
 		 102 aa  130  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2848  integration host factor subunit alpha  59.41 
 
 		 123 aa  130  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1876  histone family protein DNA-binding protein  61.46 
 
 		 123 aa  130  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2799  integration host factor subunit alpha  63.83 
 
 		 99 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1751  integration host factor, alpha subunit  61.05 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0308436 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1882  integration host factor alpha-subunit  62.11 
 
 		 113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.027165 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1314  integration host factor, alpha subunit  61.96 
 
 		 100 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0762  integration host factor subunit alpha  61.7 
 
 		 101 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.306695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2014  integration host factor subunit alpha  62.37 
 
 		 99 aa  127  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0886978  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2093  integration host factor subunit alpha  62.37 
 
 		 99 aa  127  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2493  integration host factor subunit alpha  61.54 
 
 		 98 aa  124  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.044668  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0433  integration host factor subunit alpha  60.64 
 
 		 101 aa  125  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1982  integration host factor subunit alpha  60.22 
 
 		 100 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219997  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0846  integration host factor subunit alpha  62.64 
 
 		 98 aa  123  9e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000670658  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2068  integration host factor subunit alpha  62.64 
 
 		 97 aa  123  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0298794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2055  integration host factor subunit alpha  59.57 
 
 		 100 aa  122  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549761  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1409  integration host factor subunit alpha  63.83 
 
 		 103 aa  123  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0010312  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1456  integration host factor, alpha subunit  59.14 
 
 		 99 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.405955  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2510  integration host factor subunit alpha  60.22 
 
 		 100 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1792  integration host factor subunit alpha  60.64 
 
 		 99 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28720  integration host factor subunit alpha  60.22 
 
 		 100 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000206678  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1472  integration host factor subunit alpha  63.83 
 
 		 103 aa  123  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01389  integration host factor subunit alpha  64.77 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345792  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1731  integration host factor subunit alpha  63.33 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.074622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2471  integration host factor subunit alpha  59.14 
 
 		 100 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2994  integration host factor, alpha subunit  63.33 
 
 		 97 aa  121  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2596  integration host factor subunit alpha  62.22 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1826  integration host factor subunit alpha  61.54 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3219  integration host factor subunit alpha  59.14 
 
 		 100 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2619  integration host factor subunit alpha  61.54 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2468  integration host factor subunit alpha  62.22 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0406236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1973  integration host factor subunit alpha  59.14 
 
 		 100 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0364622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1583  integration host factor subunit alpha  58.33 
 
 		 101 aa  121  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1718  integration host factor subunit alpha  61.54 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000312537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3475  integration host factor subunit alpha  59.14 
 
 		 100 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981005  hitchhiker  0.00278356 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2214  integration host factor subunit alpha  62.64 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.600475  normal  0.239128 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01681  integration host factor subunit alpha  60.22 
 
 		 99 aa  120  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00950044  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1930  integration host factor, alpha subunit  60.22 
 
 		 99 aa  120  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000106762  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1931  integration host factor subunit alpha  60.22 
 
 		 99 aa  120  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000683366  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0699  integration host factor, alpha subunit  62.64 
 
 		 110 aa  121  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.101642  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1730  integration host factor subunit alpha  61.54 
 
 		 99 aa  120  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.976876  normal  0.494462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1834  integration host factor subunit alpha  60.22 
 
 		 99 aa  120  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.155105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1467  integration host factor subunit alpha  60.22 
 
 		 99 aa  120  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2430  integration host factor subunit alpha  60.22 
 
 		 99 aa  120  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.446554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1919  integration host factor subunit alpha  60.22 
 
 		 99 aa  120  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.445655 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1478  integration host factor subunit alpha  60.22 
 
 		 99 aa  120  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1450  integration host factor subunit alpha  60.22 
 
 		 99 aa  120  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1951  integration host factor subunit alpha  60 
 
 		 98 aa  121  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0689999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1604  integration host factor subunit alpha  60.87 
 
 		 99 aa  121  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316087  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2006  integration host factor subunit alpha  60.22 
 
 		 99 aa  120  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.608113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1434  integration host factor subunit alpha  60.22 
 
 		 99 aa  120  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0289441 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01670  hypothetical protein  60.22 
 
 		 99 aa  120  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00452626  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1954  integration host factor subunit alpha  60.22 
 
 		 99 aa  120  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.57207  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2384  integration host factor, alpha subunit  59.14 
 
 		 100 aa  120  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0917658  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2168  integration host factor subunit alpha  59.14 
 
 		 100 aa  120  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1146  integration host factor subunit alpha  59.14 
 
 		 99 aa  120  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0580836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1937  integration host factor subunit alpha  59.14 
 
 		 100 aa  120  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0682795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1710  integration host factor subunit alpha  60.44 
 
 		 99 aa  120  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.707381  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2186  integration host factor subunit alpha  59.14 
 
 		 98 aa  120  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.874244  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02444  integration host factor subunit alpha  59.78 
 
 		 99 aa  120  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0239469  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1327  integration host factor, alpha subunit  57.89 
 
 		 113 aa  120  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125041  hitchhiker  0.0021642 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2150  integration host factor subunit alpha  60.44 
 
 		 98 aa  120  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.872084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0918  integration host factor, alpha subunit  59.57 
 
 		 99 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1865  integration host factor subunit alpha  60.44 
 
 		 98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>