More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2495 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2495  ABC transporter related  100 
 
 
239 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159565  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  54.24 
 
 
238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  52.14 
 
 
238 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  47.44 
 
 
236 aa  238  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  48.51 
 
 
237 aa  237  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  51.27 
 
 
239 aa  236  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  53.42 
 
 
238 aa  235  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  48.95 
 
 
247 aa  234  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  48.09 
 
 
234 aa  234  9e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  50.85 
 
 
236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  50.42 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  52.14 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  48.51 
 
 
236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  46.58 
 
 
234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 
234 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  50.21 
 
 
235 aa  232  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  50.42 
 
 
236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0510  ABC transporter related  47.88 
 
 
235 aa  230  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00193174  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  47.66 
 
 
234 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  47.44 
 
 
235 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  45.73 
 
 
238 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  48.72 
 
 
234 aa  229  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  45.3 
 
 
238 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  45.3 
 
 
238 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  45.3 
 
 
238 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  45.3 
 
 
238 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  45.3 
 
 
238 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
235 aa  228  6e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  47.01 
 
 
238 aa  228  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1102  ABC transporter related  51.49 
 
 
235 aa  228  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0079799  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.3 
 
 
238 aa  227  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  50.63 
 
 
246 aa  227  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.87 
 
 
238 aa  227  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  44.87 
 
 
238 aa  227  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  47.48 
 
 
239 aa  227  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  49.58 
 
 
238 aa  226  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  47.66 
 
 
234 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  46.58 
 
 
236 aa  226  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1498  ABC transporter related  49.36 
 
 
235 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164397  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  48.12 
 
 
247 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  48.09 
 
 
234 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  47.7 
 
 
247 aa  226  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  50.85 
 
 
238 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.87 
 
 
234 aa  225  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.87 
 
 
238 aa  225  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.87 
 
 
238 aa  225  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.87 
 
 
238 aa  225  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.87 
 
 
238 aa  225  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  47.66 
 
 
234 aa  225  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3616  ABC transporter related  48.09 
 
 
234 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.87 
 
 
238 aa  225  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  47.01 
 
 
239 aa  225  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  48.51 
 
 
237 aa  225  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.87 
 
 
238 aa  225  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  48.09 
 
 
234 aa  225  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  50.43 
 
 
234 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  50.43 
 
 
258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  46.35 
 
 
238 aa  224  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  47.86 
 
 
236 aa  224  6e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  48.12 
 
 
247 aa  224  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1952  ABC transporter related  48.09 
 
 
234 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.571715  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.36 
 
 
234 aa  224  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  49.15 
 
 
245 aa  224  9e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
236 aa  224  9e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
233 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  49.57 
 
 
238 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  46.22 
 
 
247 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  49.57 
 
 
238 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  49.57 
 
 
238 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2130  ABC transporter related  50.64 
 
 
235 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  46.86 
 
 
247 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  46.22 
 
 
247 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  46.22 
 
 
247 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  48.72 
 
 
256 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.78 
 
 
244 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  50.43 
 
 
260 aa  223  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  46.58 
 
 
238 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  46.58 
 
 
238 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  48.29 
 
 
237 aa  223  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  47.44 
 
 
235 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  50 
 
 
236 aa  222  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1566  ABC transporter related  51.06 
 
 
234 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  49.15 
 
 
234 aa  222  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  52.56 
 
 
240 aa  222  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1851  ABC transporter related  48.09 
 
 
234 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0531443  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  44.02 
 
 
238 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2888  high-affinity branched-chain amino acid transport protein (ABC transporter ATP-binding protein)  48.09 
 
 
234 aa  222  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.0641084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  47.03 
 
 
237 aa  221  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  46.58 
 
 
249 aa  221  7e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  50.85 
 
 
244 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  44.44 
 
 
234 aa  221  9e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.38 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  48.09 
 
 
237 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  46.58 
 
 
233 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  44.02 
 
 
238 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0288  ABC transporter related  50.63 
 
 
241 aa  220  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  44.44 
 
 
237 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0608  ATPase  48.51 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1661  ABC transporter related  48.09 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1482  ABC transporter related  48.94 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>